Влияние специфической антибактериальной терапии на распространенность устойчивых к человеческому организму бактерий-хозяев (SATURN)

Мы проведем обсервационное продольное проспективное исследование в 3 больницах в отделениях с высокой распространенностью устойчивых микроорганизмов. Пациенты, давшие согласие, будут проверены на носительство микроорганизмов УПП при поступлении, а те, у кого будет установлено, что они являются носителями целевого БРА, будут включены в лонгитюдное исследование. Для повышения эффективности скрининга мы можем использовать стратификацию риска на основе факторов риска, выявленных в каждом центре. Пациентам, включенным в продольное исследование, будет предложено предоставлять серийные образцы стула каждые 2-3 дня во время госпитализации (ректальный мазок будет разрешен в качестве замены образца стула после разработки соответствующей методологии для корреляции между образцами стула и ректальными мазками).

Эти образцы будут проанализированы с использованием количественных культур для определения количества устойчивых организмов, а образцы будут подвергнуты количественной ПЦР в реальном времени для количественного определения устойчивых генов (CTX-M, TEM, SHV, KPC, VIM по мере необходимости). Параллельно с использованием аналогичных методов будет изучаться и количественно определяться загрязнение окружающей среды. Ежедневно будут собираться данные о лечении антибиотиками, других лекарствах, клинических параметрах, дефекации и наличии диареи, а также различных показателях ФК/ФД. Целевые антибиотики для этого исследования включают обычно используемые в стационаре агенты, включая хинолоны, цефалоспорины, пиперациллин/тазобактам, эртапенем, имипенем, дорипенем, метронидазол, клиндамицин и аминогликозиды. Будут изучены продолжительность, последовательный порядок лечения и показатели ФК/ФД. Эффекты хирургической антибиотикопрофилактики будут рассмотрены как важная конечная точка. Влияние целевых антибиотиков/классов на селекцию, обогащение и распространение целевых организмов УПП. Будут проведены анализы для сравнения: 1. действия различных антибиотиков 2. влияния продолжительности терапии 3. продолжительности эффекта (после лечения). 4. Влияние индексов ФК/ФД.

Будет проведен вторичный анализ риска развития инфекций в зависимости от различных факторов, включая время и нагрузку носительства резистентных организмов и воздействия антибиотиков. Будет проведена корреляция с клиническими изолятами, включая типирование, анализ генов и плазмид для определения корреляции между колонизирующими и инфицирующими штаммами. Будет проведен эксперимент, имитирующий контакт с пациентом, для изучения загрязнения рук, перчаток и халатов после контакта, чтобы установить корреляцию между загрязнением окружающей среды и заражением медицинских работников. Будет проведена дополнительная работа по профилированию бактериальных сообществ с помощью методов ДНК-отпечатков пальцев с использованием гетерогенности длины (LH-PCR) и автоматического анализа внутренних спейсеров рибосом (ARISA) на образце исследованных пациентов.