Effekten av spesifikke antibiotikabehandlinger på forekomsten av menneskelige vertsresistente bakterier (SATURN)

Vi vil gjennomføre en observasjons longitudinell prospektiv studie på 3 sykehus i enheter med høy forekomst av resistente organismer. Pasienter som samtykker vil bli screenet for transport av AMR-organismer ved innleggelse, og de som er funnet å være bærere av mål-ARB vil bli inkludert i den longitudinelle studien. For å forbedre utbyttet av screening kan vi bruke risikostratifisering basert på risikofaktorer identifisert ved hvert senter. Pasienter inkludert i den longitudinelle studien vil bli bedt om å gi serielle avføringsprøver hver 2.-3. dag under sykehusinnleggelse (rektal vattpinne vil bli tillatt som erstatning for avføringsprøve, etter å ha utviklet passende metodikk for å korrelere mellom avføringsprøver og rektale vattpinner).

Disse prøvene vil bli analysert ved bruk av kvantitative kulturer for antall resistente organismer, og prøvene vil bli gjenstand for kvantitativ sanntids-PCR for å kvantifisere resistente gener (CTX-M, TEM, SHV, KPC, VIM etter behov). Parallelt vil miljøforurensning undersøkes og kvantifiseres med tilsvarende metoder. Data vil bli samlet inn daglig om antibiotikabehandling, andre medisiner, kliniske parametere, tarmbevegelser og tilstedeværelse av diaré, og ulike PK/PD-indekser. Målantibiotikumet for denne studien inkluderer midler som ofte brukes på sykehus, inkludert kinoloner, cefalosporiner, piperacillin/tazobactam, ertapenem, imipenem, doripenem, metronidazol, klindamycin og aminoglykosider. Varigheten, den sekvensielle behandlingsrekkefølgen og PK/PD-indekser vil bli undersøkt. Effektene av kirurgisk antibiotikaprofylakse vil bli undersøkt som et viktig endepunkt. Effektene av målantibiotikamidlene/-klassene på seleksjon, berikelse og spredning av mål-AMR-organismene. Det vil bli utført analyser for å sammenligne: 1. effekten av ulike antibiotika 2. effekten av behandlingens varighet 3. effektens varighet (etterbehandling). 4. Effektene av PK/PD-indekser.

Sekundæranalyse vil undersøke risikoen for å utvikle infeksjoner som funksjon av ulike faktorer, inkludert tid og belastning av transport av resistente organismer og eksponering for antibiotika vil bli utført. Korrelasjon med kliniske isolater vil bli utført inkludert typing, gen- og plasmidanalyser for å bestemme korrelasjon mellom koloniserende og infiserte stammer. Eksperiment som simulerer pasientkontakt vil bli utført for å undersøke forurensning av hender, hansker og kjoler etter kontakt for å korrelere mellom miljøforurensning og forurensning av helsepersonell. Ytterligere arbeid vil bli utført med profilering av bakteriesamfunn ved hjelp av DNA-fingeravtrykksteknikker ved bruk av lengdeheterogenitet (LH-PCR) og automatisert ribosomal intern spacer-analyse (ARISA) på en prøve av pasientene som ble studert.