Klinisk mikrobiel art og antibiotikaresistens-ID hos ED-patienter, der præsenterer sig med infektion - er hurtig ID mulig og nøjagtig?

Dramatisk forbedring i rettidig og effektiv behandling af patienter ramt af sepsis kan opnås med implementering af moderne teknologier til identifikation af fornærmende mikrobielle arter og deres medfødte genetiske antibiotikabehandlingsmål. Vores samarbejdshold planlægger at imødekomme dette behov ved hjælp af en Point-of-Care (POC)-enhed udstyret til identifikation af en bakterieart inden for 60 minutter efter en rutinemæssig laboratorieudtagning på akutafdelingen eller anden prøvetagning, efterfulgt af målrettet analyse af dens medfødte genetiske antibiotikaresistenselementer inden for så lidt som 7 timers tid. Denne revolutionerende forbedring af den kliniske håndtering er afgørende for at forbedre patientresultaterne for et sygdomssyndrom, der ikke kun er meget udbredt på verdensplan, og som forbruger en massiv mængde medicinske ressourcer dagligt, men som kun truer med at fortsætte med at forværre givet den nuværende praksis for antibiotikaforvaltning. Tidlig målrettet terapi (EGDT) er standarden, hvormed medicinske interventioner nu formes på tværs af felter i moderne kliniske omgivelser, lige fra traumer og neurokirurgi til kardiologi og infektionssygdomme. Hurtige og nøjagtige diagnoser, parret med aggressiv og effektiv indgriben, er åbenbare for at bremse sygdomsprocessen samt opretholde økonomisk gennemførlig pleje og forbedre langsigtet sygelighed. Indsatsen for at anvende EGDT til patienter med høj risiko for systemisk infektion, sepsis, blev påbegyndt for over et årti siden af ​​Rivers og kolleger i akutafdelingen. Systematiske tilgange til tidlig sepsis identifikation og intervention, herunder bredspektret antibiotikadækning, og tilstrækkelig væskevolumen genoplivning har givet klare forbedringer i patientresultater og sundhedsressourceudnyttelse. Det er blevet erkendt, at en af ​​de begrænsende faktorer ved behandling af sepsis i hospitalsmiljøet er rettidigheden af ​​patogenidentifikation og implementering af passende antimikrobiel terapi. Den nuværende "guldstandard" for sepsis mikrobiel identifikation er blodkultur, som tager 3-5 dage for en endelig artsidentifikation. Modtagelighed for antimikrobielle midler for den givne organisme opnås generelt inden for samme tidsramme. I den periode, det tager fra prøvetagning til dyrkningsresultater, skal der dog tilvejebringes empirisk bredspektret antibiotikadækning, som ofte involverer flere antibiotika, for at sikre udryddelse af organismen. Dette forslag har til formål at bruge Point of Care (POC)-testning, som beskrevet af investigatos' laboratorium, til nøjagtigt at identificere patogene mikroorganismer hos patienter med mistanke om sepsis inden for 20 minutter efter en laboratorieprøvetagning eller urinopsamling. Omfanget af efterforskernes forslag er gennemførligt, idet 20 organismer tegner sig for 87 % af mikrobielle infektioner identificeret ved kulturbaserede teknikker på Sparrow Hospital, der repræsenterer det større Lansing, Michigan-området, og 50 mikroorganismer vil tegne sig for stort set alle mikrobielle infektiøse arter ( Khalife, 2011, upublicerede data). I foreløbige undersøgelser har efterforskerne valideret denne tilgang med laboratoriebehandlede prøver af Escherichia coli og Staphylococcus aureus. Efterforskerne er nu ved at oprette paneler for flere typer infektioner og har valideret disse bestræbelser på over 30 mikroorganismer. POC-testning vil nu blive udvidet til at omfatte yderligere mikroorganismer, der ofte forekommer hos sepsispatienter eller dem med andre identificerbare smitsomme kilder. Sekundært vil antimikrobielle resistensgener blive scannet ved hjælp af en funktionel genomisk tilgang med meget parallel kvantitativ PCR som udført af efterforskernes laboratorium i en tidligere undersøgelse, der udforsker mikrobiotaen i mave-tarmkanalen hos svin.