Kliniska mikrobiella arter och antibiotikaresistens-ID hos ED-patienter som presenterar sig med infektion - är snabb ID möjlig och exakt?

Dramatisk förbättring av snabb och effektiv behandling av patienter som drabbats av sepsis kan uppnås med implementering av modern teknik för identifiering av kränkande mikrobiella arter och deras medfödda genetiska antibiotikabehandlingsmål. Vårt samarbetsteam planerar att tillgodose detta behov med hjälp av en Point-of-Care (POC)-enhet utrustad för identifiering av en bakterieart inom 60 minuter efter en rutinmässig blodtagning på akutmottagningen eller annan provtagning, följt av målinriktad analys av dess medfödda genetiska antibiotikaresistenselement inom så lite som 7 timmar. Denna revolutionerande förbättring av klinisk hantering är avgörande för att förbättra patientresultaten för ett sjukdomssyndrom som inte bara är högt utbrett över hela världen, som konsumerar en enorm mängd medicinska resurser dagligen, utan som bara hotar att fortsätta att förvärras givet nuvarande antibiotikaförvaltningspraxis. Tidig målstyrd terapi (EGDT) är standarden enligt vilken medicinska interventioner nu formas över fält i den moderna kliniska miljön, allt från trauma och neurokirurgi till kardiologi och infektionssjukdomar. Snabba och exakta diagnoser, parat med aggressiv och effektiv intervention, är uppenbara för att hejda sjukdomsprocessen samt att upprätthålla ekonomiskt genomförbar vård och förbättra långvarig sjuklighet. Ansträngningen att applicera EGDT på patienter med hög risk för systemisk infektion, sepsis, initierades för över ett decennium sedan av Rivers och kollegor på akutmottagningen. Systematiska tillvägagångssätt för tidig sepsis identifiering och intervention inklusive bredspektrum antibiotikatäckning och adekvat återupplivning av vätskevolymer har gett definitiva förbättringar i patientresultat och sjukvårdsresurser. Det har insetts att en av de begränsande faktorerna vid behandling av sepsis i sjukhusmiljö är aktualiteten av patogenidentifiering och implementering av lämplig antimikrobiell terapi. Den nuvarande "guldstandarden" för identifiering av mikrobiell sepsis är blododling, vilket tar 3-5 dagar för en definitiv artidentifiering. Mottaglighet för antimikrobiella medel för den givna organismen samlas i allmänhet inom samma tidsram. Under den period det tar från provtagning till odlingsresultat måste dock empirisk bredspektrumantibiotikatäckning, som ofta involverar flera antibiotika, tillhandahållas för att säkerställa utrotning av organismer. Detta förslag syftar till att använda Point of Care (POC)-testning, enligt beskrivningen av investigatos laboratorium, för att exakt identifiera patogena mikroorganismer hos patienter med misstänkt sepsis inom 20 minuter efter en laboratorieblodtagning eller urinsamling. Omfattningen av utredarnas förslag är genomförbar eftersom 20 organismer står för 87 % av mikrobiella infektioner som identifierats med odlingsbaserade tekniker vid Sparrow Hospital, som representerar det större Lansing, Michigan-området, och 50 mikroorganismer skulle stå för praktiskt taget alla mikrobiella smittsamma arter ( Khalife, 2011, opublicerade data). I preliminära studier har utredarna validerat denna metod med laboratoriebearbetade prover av Escherichia coli och Staphylococcus aureus. Utredarna skapar nu paneler för flera typer av infektioner och har validerat dessa ansträngningar på över 30 mikroorganismer. POC-testning kommer nu att utökas till att inkludera ytterligare mikroorganismer som vanligtvis påträffas hos sepsispatienter eller de med andra identifierbara infektionskällor. Sekundärt kommer gener för antimikrobiell resistens att skannas med hjälp av en funktionell genomik-metod med högparallell kvantitativ PCR som utförts av utredarnas laboratorium i en tidigare studie som utforskar mikrobiotan i mag-tarmkanalen hos svin.