Kliniczne gatunki drobnoustrojów i identyfikacja oporności na antybiotyki u pacjentów z ostrym dyżurem zgłaszających się z infekcją — czy szybka identyfikacja jest możliwa i dokładna?

Drastyczną poprawę w terminowym i skutecznym leczeniu pacjentów dotkniętych sepsą można osiągnąć dzięki wdrożeniu nowoczesnych technologii identyfikacji szkodliwych gatunków drobnoustrojów i ich wrodzonych genetycznych celów leczenia antybiotykami. Nasz współpracujący zespół planuje odpowiedzieć na tę potrzebę za pomocą urządzenia Point-of-Care (POC) wyposażonego w sprzęt do identyfikacji gatunku bakterii w ciągu 60 minut od rutynowego pobrania krwi w laboratorium Oddziału Ratunkowego lub innego pobrania próbki, po którym następuje ukierunkowana analiza jego wrodzonych cech genetycznych elementów oporności na antybiotyki w ciągu zaledwie 7 godzin. Ta rewolucyjna poprawa w zarządzaniu klinicznym ma kluczowe znaczenie dla poprawy wyników pacjentów w przypadku zespołu chorobowego, który nie tylko jest bardzo rozpowszechniony na całym świecie i codziennie pochłania ogromne ilości zasobów medycznych, ale który grozi jedynie dalszym pogorszeniem, biorąc pod uwagę obecne praktyki zarządzania antybiotykami. Wczesna terapia ukierunkowana na cel (EGDT) jest standardem, według którego interwencje medyczne są obecnie kształtowane w różnych dziedzinach we współczesnym środowisku klinicznym, od urazów i neurochirurgii po kardiologię i choroby zakaźne. Szybka i dokładna diagnoza, połączona z agresywną i skuteczną interwencją, przyczynia się do powstrzymania procesu chorobowego, jak również utrzymania opłacalnej ekonomicznie opieki i poprawy długoterminowej zachorowalności. Próby zastosowania EGDT u pacjentów z grupy wysokiego ryzyka infekcji ogólnoustrojowej, posocznicy, zostały zapoczątkowane ponad dziesięć lat temu przez Riversa i współpracowników na oddziale ratunkowym. Systematyczne podejście do wczesnej identyfikacji i interwencji sepsy, w tym antybiotykoterapia o szerokim spektrum działania i resuscytacja z odpowiednią objętością płynów, przyniosły zdecydowaną poprawę wyników pacjentów i wykorzystania zasobów opieki zdrowotnej. Uznano, że jednym z czynników ograniczających leczenie sepsy w warunkach szpitalnych jest terminowość identyfikacji patogenu i wdrożenie odpowiedniej antybiotykoterapii. Obecnym „złotym standardem” identyfikacji drobnoustrojów sepsy jest posiew krwi, co do ostatecznej identyfikacji gatunku zajmuje 3-5 dni. Wrażliwość danego organizmu na środki przeciwdrobnoustrojowe jest generalnie określana w tych samych ramach czasowych. Jednak w okresie, jaki upływa od pobrania próbki do uzyskania wyników posiewu, należy zapewnić empiryczną antybiotykoterapię o szerokim spektrum działania, często obejmującą wiele antybiotyków, aby zapewnić eradykację drobnoustrojów. Ta propozycja ma na celu wykorzystanie testów Point of Care (POC), opisanych przez laboratorium badaczy, do dokładnej identyfikacji drobnoustrojów chorobotwórczych u pacjentów z podejrzeniem posocznicy w ciągu 20 minut od laboratoryjnego pobrania krwi lub moczu. Zakres propozycji badaczy jest wykonalny, ponieważ 20 organizmów odpowiada za 87% zakażeń drobnoustrojami zidentyfikowanych technikami opartymi na hodowli w szpitalu Sparrow, reprezentującym większy obszar Lansing w stanie Michigan, a 50 mikroorganizmów odpowiadałoby za praktycznie każdy gatunek zakaźny drobnoustrojów ( Khalife, 2011, dane niepublikowane). We wstępnych badaniach badacze potwierdzili to podejście z laboratoryjnie przetworzonymi próbkami Escherichia coli i Staphylococcus aureus. Badacze tworzą teraz panele dla wielu rodzajów infekcji i potwierdzili te wysiłki na ponad 30 mikroorganizmach. Testy POC zostaną teraz rozszerzone o dodatkowe mikroorganizmy powszechnie spotykane u pacjentów z sepsą lub z innymi możliwymi do zidentyfikowania źródłami infekcji. Po drugie, geny oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe zostaną zeskanowane przy użyciu podejścia genomiki funkcjonalnej z wysoce równoległym ilościowym PCR, jak zostało przeprowadzone przez laboratorium badaczy w poprzednim badaniu badającym mikroflorę przewodu pokarmowego świni.