Klinische microbiële soorten en antibioticaresistentie ID bij ED-patiënten met infectie - is snelle identificatie mogelijk en nauwkeurig?

Een drastische verbetering in de tijdige en effectieve behandeling van patiënten met sepsis kan worden bereikt met de implementatie van moderne technologieën voor de identificatie van aanstootgevende microbiële soorten en hun aangeboren genetische antibioticabehandelingsdoelen. Ons samenwerkingsteam is van plan om aan deze behoefte te voldoen met behulp van een Point-of-Care (POC)-apparaat dat is uitgerust voor identificatie van een bacteriesoort binnen 60 minuten na een routinematige bloedafname in het laboratorium van de afdeling spoedeisende hulp of een andere monsterafname, gevolgd door gerichte analyse van de aangeboren bacteriesoort. genetische antibioticaresistentie-elementen binnen slechts 7 uur tijd. Deze revolutionaire verbetering in klinisch management is van cruciaal belang voor het verbeteren van de patiëntresultaten voor een ziektesyndroom dat niet alleen wereldwijd veel voorkomt, dagelijks een enorme hoeveelheid medische middelen verbruikt, maar dat alleen maar dreigt te verslechteren gezien de huidige praktijken van antibioticabeheer. Vroege doelgerichte therapie (EGDT) is de standaard waarmee medische interventies nu vorm krijgen op verschillende gebieden in de moderne klinische setting, variërend van trauma en neurochirurgie tot cardiologie en infectieziekten. Snelle en nauwkeurige diagnoses, gecombineerd met agressieve en effectieve interventie, zijn manifest om het ziekteproces te stoppen, economisch haalbare zorg in stand te houden en morbiditeit op de lange termijn te verbeteren. De poging om EGDT toe te passen op patiënten met een hoog risico op systemische infectie, sepsis, werd meer dan tien jaar geleden geïnitieerd door Rivers en collega's op de afdeling spoedeisende hulp. Systematische benaderingen voor vroege identificatie en interventie van sepsis, waaronder breedspectrumantibioticumdekking en adequate reanimatie van het vochtvolume, hebben duidelijke verbeteringen opgeleverd in de patiëntresultaten en het gebruik van gezondheidszorgmiddelen. Erkend wordt dat een van de beperkende factoren bij de behandeling van sepsis in het ziekenhuis de tijdige identificatie van pathogenen en de implementatie van geschikte antimicrobiële therapie is. De huidige "gouden standaard" voor microbiële identificatie van sepsis is bloedkweek, wat 3-5 dagen duurt voor een definitieve soortidentificatie. De gevoeligheid voor antimicrobiële middelen voor het gegeven organisme wordt over het algemeen binnen hetzelfde tijdsbestek verkregen. In de periode tussen monsterverzameling en kweekresultaten moet echter worden voorzien in empirische breedspectrumantibioticumdekking, waarbij vaak meerdere antibiotica betrokken zijn, om de uitroeiing van het organisme te waarborgen. Dit voorstel heeft tot doel gebruik te maken van Point of Care (POC)-testen, zoals beschreven door het onderzoekslaboratorium, om pathogene micro-organismen nauwkeurig te identificeren bij patiënten met vermoedelijke sepsis binnen 20 minuten na bloedafname of urineverzameling in het laboratorium. De reikwijdte van het voorstel van de onderzoekers is haalbaar omdat 20 organismen verantwoordelijk zijn voor 87% van de microbiële infecties die zijn geïdentificeerd door op cultuur gebaseerde technieken in het Sparrow Hospital, die het grotere Lansing, Michigan-gebied vertegenwoordigen, en 50 micro-organismen zouden verantwoordelijk zijn voor vrijwel elke microbiële infectieuze soort ( Khalife, 2011, ongepubliceerde gegevens). In voorbereidende studies hebben de onderzoekers deze aanpak gevalideerd met in het laboratorium verwerkte monsters van Escherichia coli en Staphylococcus aureus. De onderzoekers maken nu panels voor meerdere soorten infecties en hebben deze inspanningen op meer dan 30 micro-organismen gevalideerd. POC-testen zullen nu worden uitgebreid met aanvullende micro-organismen die vaak worden aangetroffen bij sepsispatiënten of patiënten met andere identificeerbare infectieuze bronnen. Ten tweede zullen antimicrobiële resistentiegenen worden gescand met behulp van een functionele genomics-benadering met zeer parallelle kwantitatieve PCR zoals uitgevoerd door het laboratorium van de onderzoekers in een eerdere studie waarin de microbiota van het maagdarmkanaal van varkens wordt onderzocht.