Identificación de especies microbianas clínicas y resistencia a los antibióticos en pacientes con urgencias que presentan una infección: ¿es posible y precisa la identificación rápida?

Se puede lograr una mejora drástica en el tratamiento oportuno y eficaz de los pacientes que padecen sepsis con la implementación de tecnologías modernas para la identificación de especies microbianas agresoras y sus objetivos de tratamiento con antibióticos genéticos innatos. Nuestro equipo de colaboración planea abordar esta necesidad utilizando un dispositivo de punto de atención (POC) equipado para la identificación de una especie bacteriana dentro de los 60 minutos de una extracción de sangre de laboratorio de rutina del Departamento de Emergencias u otra recolección de muestras, seguido de un análisis específico de su innato elementos genéticos de resistencia a los antibióticos en tan solo 7 horas. Esta mejora revolucionaria en el manejo clínico es fundamental para mejorar los resultados de los pacientes con un síndrome de enfermedad que no solo es muy prevalente en todo el mundo y consume una gran cantidad de recursos médicos diariamente, sino que solo amenaza con seguir empeorando dadas las prácticas actuales de administración de antibióticos. La terapia temprana dirigida por objetivos (EGDT, por sus siglas en inglés) es el estándar por el cual las intervenciones médicas ahora se configuran en todos los campos en el entorno clínico moderno, que van desde trauma y neurocirugía hasta cardiología y enfermedades infecciosas. Los diagnósticos rápidos y precisos, junto con una intervención agresiva y eficaz, se manifiestan para detener el proceso de la enfermedad, así como para mantener una atención económicamente viable y mejorar la morbilidad a largo plazo. El esfuerzo por aplicar EGDT a pacientes con alto riesgo de infección sistémica, sepsis, fue iniciado hace más de una década por Rivers y sus colegas en el Departamento de Emergencias. Los enfoques sistemáticos para la identificación e intervención tempranas de la sepsis, incluida la cobertura de antibióticos de amplio espectro y la reanimación con un volumen adecuado de líquidos, han producido mejoras definitivas en los resultados de los pacientes y la utilización de los recursos de atención médica. Se ha reconocido que uno de los factores limitantes en el tratamiento de la sepsis en el ámbito hospitalario es la oportunidad de la identificación de patógenos y la implementación de la terapia antimicrobiana adecuada. El "estándar de oro" actual de la identificación microbiana de la sepsis es el hemocultivo, que lleva de 3 a 5 días para una identificación definitiva de la especie. La susceptibilidad a los agentes antimicrobianos para el organismo dado generalmente se obtiene dentro de este mismo marco de tiempo. Sin embargo, en el período que transcurre desde la recolección de la muestra hasta los resultados del cultivo, se debe proporcionar una cobertura antibiótica empírica de amplio espectro, que a menudo involucra múltiples antibióticos, para garantizar la erradicación del organismo. Esta propuesta tiene como objetivo utilizar las pruebas en el punto de atención (POC), según lo descrito por el laboratorio de los investigadores, para identificar con precisión los microorganismos patógenos en pacientes con sospecha de sepsis dentro de los 20 minutos de una extracción de sangre o de orina en el laboratorio. El alcance de la propuesta de los investigadores es factible porque 20 organismos representan el 87 % de las infecciones microbianas identificadas mediante técnicas basadas en cultivos en el Sparrow Hospital, que representa el área metropolitana de Lansing, Michigan, y 50 microorganismos representarían prácticamente todas las especies microbianas infecciosas ( Khalife, 2011, datos no publicados). En estudios preliminares, los investigadores validaron este enfoque con muestras procesadas en laboratorio de Escherichia coli y Staphylococcus aureus. Los investigadores ahora están creando paneles para múltiples tipos de infecciones y han validado estos esfuerzos en más de 30 microorganismos. Las pruebas POC ahora se ampliarán para incluir microorganismos adicionales que se encuentran comúnmente en pacientes con sepsis o aquellos con otras fuentes infecciosas identificables. En segundo lugar, los genes de resistencia a los antimicrobianos se escanearán utilizando un enfoque de genómica funcional con PCR cuantitativa altamente paralela como la realizada por el laboratorio de investigadores en un estudio anterior que explora la microbiota del tracto gastrointestinal porcino.