Identification des espèces microbiennes cliniques et de la résistance aux antibiotiques chez les patients du service des urgences présentant une infection - L'identification rapide est-elle possible et précise ?

Une amélioration spectaculaire du traitement rapide et efficace des patients atteints de septicémie peut être obtenue grâce à la mise en œuvre de technologies modernes d'identification des espèces microbiennes incriminées et de leurs cibles génétiques innées de traitement antibiotique. Notre équipe collaborative prévoit de répondre à ce besoin à l'aide d'un dispositif de point de service (POC) équipé pour l'identification d'une espèce bactérienne dans les 60 minutes suivant un prélèvement sanguin de routine en laboratoire au service des urgences ou un autre prélèvement d'échantillons, suivi d'une analyse ciblée de son innée éléments génétiques de résistance aux antibiotiques en aussi peu que 7 heures. Cette amélioration révolutionnaire de la gestion clinique est essentielle pour améliorer les résultats des patients pour un syndrome pathologique qui est non seulement très répandu dans le monde, consommant quotidiennement une quantité massive de ressources médicales, mais qui ne fait que menacer de continuer à s'aggraver compte tenu des pratiques actuelles de gestion des antibiotiques. La thérapie précoce axée sur les objectifs (EGDT) est la norme par laquelle les interventions médicales sont désormais façonnées dans tous les domaines du cadre clinique moderne, allant de la traumatologie et de la neurochirurgie à la cardiologie et aux maladies infectieuses. Des diagnostics rapides et précis, associés à une intervention agressive et efficace, sont manifestes pour endiguer le processus de la maladie ainsi que pour maintenir des soins économiquement réalisables et améliorer la morbidité à long terme. L'effort d'appliquer l'EGDT aux patients à haut risque d'infection systémique, la septicémie, a été lancé il y a plus de dix ans par Rivers et ses collègues du service des urgences. Les approches systématiques d'identification et d'intervention précoces du sepsis, y compris la couverture antibiotique à large spectre et la réanimation à volume de liquide adéquat, ont permis d'améliorer nettement les résultats pour les patients et l'utilisation des ressources de soins de santé. Il a été reconnu que l'un des facteurs limitants du traitement de la septicémie en milieu hospitalier est la rapidité d'identification des agents pathogènes et la mise en œuvre d'une thérapie antimicrobienne appropriée. L'"étalon-or" actuel de l'identification microbienne du sepsis est l'hémoculture, qui prend 3 à 5 jours pour une identification définitive de l'espèce. La sensibilité aux agents antimicrobiens pour l'organisme donné est généralement recueillie dans ce même laps de temps. Cependant, dans la période qui s'écoule entre la collecte des échantillons et les résultats de la culture, une couverture antibiotique empirique à large spectre, impliquant souvent plusieurs antibiotiques, doit être fournie pour assurer l'éradication de l'organisme. Cette proposition vise à utiliser les tests au point de service (POC), tels que décrits par le laboratoire des investigateurs, pour identifier avec précision les micro-organismes pathogènes chez les patients suspects de septicémie dans les 20 minutes suivant une prise de sang ou une collecte d'urine en laboratoire. La portée de la proposition des chercheurs est réalisable dans la mesure où 20 organismes représentent 87 % des infections microbiennes identifiées par des techniques basées sur la culture à l'hôpital Sparrow, représentant la grande région de Lansing, Michigan, et 50 micro-organismes représenteraient pratiquement toutes les espèces infectieuses microbiennes ( Khalife, 2011, données non publiées). Dans des études préliminaires, les chercheurs ont validé cette approche avec des échantillons d'Escherichia coli et de Staphylococcus aureus traités en laboratoire. Les chercheurs créent maintenant des panels pour plusieurs types d'infections et ont validé ces efforts sur plus de 30 micro-organismes. Les tests POC seront désormais étendus pour inclure des micro-organismes supplémentaires couramment rencontrés chez les patients atteints de septicémie ou ceux présentant d'autres sources infectieuses identifiables. En second lieu, les gènes de résistance aux antimicrobiens seront scannés à l'aide d'une approche de génomique fonctionnelle avec une PCR quantitative hautement parallèle telle que réalisée par le laboratoire des chercheurs dans une précédente étude explorant le microbiote du tractus gastro-intestinal porcin.