Genomisk sekvensering og personlig behandling af fødselsdefekter på neonatale intensivafdelinger

Neonatal medfødt misdannelse er en af ​​de hyppigste årsager til spædbørnsdød i den vestlige verden og større byer i Kina. Der er mange forskellige typer af medfødte misdannelser, og nogle af disse kan være forårsaget af ændringer i genmutation. Næste generations sekventering (NGS) er en høj-throughput parallel sekventering, der kan give genetisk information med høj nøjagtighed. Det er en hurtigere og omkostningseffektiv metode til at opdage genmutationer sammenlignet med Sanger-sekventering. Vi håber at koble genomiske teknikker med mere traditionelle metoder involveret i genetisk opdagelse for at undersøge en bred vifte af tilstande, for hvilke der er stærke beviser for, at genetiske faktorer er involveret. Så i denne undersøgelse evaluerede vi den kliniske rolle af NGS-testning for neonatal genetisk sygdom hos nyfødte sammenlignet med Sanger-sekventering for at observere, om denne nye teknologi signifikant kan forkorte undersøgelsestiden, forbedre diagnosehastigheden, vejlede interventionsbehandlingerne og fremme prognosen.

Disse nyfødte, som har en udiagnosticeret sygdom, og delvise familier, vil være berettiget til at deltage i undersøgelsen. Undersøgelsespopulationen vil blive rekrutteret fra børnehospitalet på Fudan Universitys indlagte befolkning, primært neonatal intensivafdeling (NICU), med en underpopulation, der præsenterer sig for andre hospitaler i Kina. Alle berørte undersøgelsesdeltagere vil modtage en genetisk screening i henhold til deres kliniske symptom. Alle forsøgspersoner vil få udtaget blod til DNA-isolering og genomisk sekventering på tidspunktet for tilmelding til undersøgelsen. Alle blodprøvevolumener vil overholde Fudan-proceduren for maksimalt blod hos pædiatriske patienter. Derudover kan cerebrospinalvæske og vævsprøver indsamles og opbevares i banken af ​​bioprøver. DNA vil blive isoleret og forberedt til NGS eller Sanger med Fudan-protokoller på Translational Medicine Center of Children's Hospital of Fudan University. Der vil også blive opnået delvise familiære prøver, og nukleinsyrer vil også blive sekventeret, som angivet, for at hjælpe med diagnosticering af den genetiske sygdom hos den nyfødte. Alle sekventeringsdata vil blive lagret i Genome Center Biorepository. I tilfælde af positive undersøgelsesresultater, der kan være diagnostiske, vil vores investigator udføre bekræftende klinisk diagnostisk test, og hvis bekræftet, vil en standard klinisk diagnostisk rapport blive placeret i patientens journal. Opfølgning med patientens familie vil blive vejledt af det kliniske plejeteam. Både resultater af molekylære diagnoser og varighed til diagnose vil blive registreret som primære resultater.

Derudover vil denne information hjælpe med at lindre angst hos familien og giver også en mekanisme til patientovergang til den hurtige NGS-arm, hvis patienten er klinisk forværret, og på det kliniske plejeteams anmodning. Hver gang en undersøgelsesdeltager tilmeldes, vil klinikeren og forældrene blive bedt om at udfylde en undersøgelse før NGS-testning og efter returnering af resultater. Vi vil også gennemgå patientens journal og indsamle kliniske variabler, herunder laboratorieundersøgelser, radiologiresultater, medicin og andre behandlinger modtaget for yderligere at analysere den effekt NGS har på den kliniske pleje. Så det ultimative mål er individualiseret eller personlig terapi. Vi planlægger at følge op med familier årligt op til 18 måneder efter tilmelding og registrere kliniske resultater relateret til denne undersøgelse.