Genomisk sekvensering og personlig behandling for fødselsdefekter i neonatale intensivavdelinger

Neonatal medfødt misdannelse er en av de hyppigste årsakene til spedbarnsdød i den vestlige verden og store byer i Kina. Det finnes mange forskjellige typer medfødte misdannelser, og noen av disse kan være forårsaket av endringer i genmutasjoner. Neste generasjons sekvensering (NGS) er en parallell sekvensering med høy gjennomstrømning som kan gi genetisk informasjon med høy nøyaktighet. Det er en raskere og kostnadseffektiv metode for å oppdage genmutasjoner sammenlignet med Sanger-sekvensering. Vi håper å koble genomiske teknikker med mer tradisjonelle metoder involvert i genetisk oppdagelse for å undersøke et bredt spekter av tilstander som det er sterke bevis for at genetiske faktorer er involvert for. Så i denne studien evaluerte vi den kliniske rollen til NGS-testing for neonatal genetisk sykdom hos nyfødte sammenlignet med Sanger-sekvensering for å observere om denne nye teknologien betydelig kan forkorte undersøkelsestiden, forbedre diagnosehastigheten, veilede intervensjonsbehandlinger og fremme prognose.

Disse nyfødte som har en udiagnostisert sykdom, og delvis familier, vil være kvalifisert til å delta i studien. Studiepopulasjonen vil bli rekruttert fra barnesykehuset ved Fudan University inneliggende populasjon, primært neonatal intensivavdeling (NICU), med en underpopulasjon som presenteres for andre sykehus i Kina. Alle berørte studiedeltakere vil motta en genetisk screening i henhold til deres kliniske symptom. Alle forsøkspersoner vil få tatt blod for DNA-isolering og genomisk sekvensering på tidspunktet for registrering i studien. Alle blodprøvevolumer vil følge Fudan-prosedyren for maksimalt blod hos pediatriske pasienter. I tillegg kan cerebrospinalvæske og vevsprøver samles og lagres i bioprøvebanken. DNA vil bli isolert og klargjort for NGS eller Sanger med Fudan-protokoller ved Translational Medicine Center of Children's Hospital of Fudan University. Delvis familiære prøver vil også bli tatt, og nukleinsyrer vil også bli sekvensert, som angitt, for å hjelpe til med diagnostisering av den genetiske sykdommen hos den nyfødte. Alle sekvenseringsdata vil bli lagret i Genome Center Biorepository. I tilfelle positive studiefunn som kan være diagnostiske, vil vår etterforsker utføre bekreftende klinisk diagnostisk testing og, hvis bekreftet, vil en standard klinisk diagnostisk rapport bli plassert i pasientens journal. Oppfølging med pasientens familie vil bli veiledet av det kliniske omsorgsteamet. Både molekylære diagnoseresultater og varighet til diagnose vil bli registrert som primære utfall.

I tillegg vil denne informasjonen bidra til å lindre angst fra familiens side, og gir også en mekanisme for pasientovergang til den raske NGS-armen dersom pasienten er klinisk forverret, og på forespørsel fra det kliniske omsorgsteamet. Hver gang en studiedeltaker registreres, vil klinikeren og foreldrene bli bedt om å fylle ut en spørreundersøkelse før NGS-testing og etter retur av resultater. Vi vil også gjennomgå pasientens journal og samle inn kliniske variabler, inkludert laboratorietesting, radiologiresultater, medisiner og andre behandlinger mottatt for å videre analysere effekten NGS har på klinisk omsorg. Så det endelige målet er individualisert eller personlig terapi. Vi planlegger å følge opp med familier årlig opp til 18 måneder etter påmelding og registrere kliniske resultater relatert til denne studien.