Sekwencjonowanie genomu i spersonalizowane leczenie wad wrodzonych na oddziałach intensywnej terapii noworodków

Wrodzone wady rozwojowe noworodków są jedną z najczęstszych przyczyn śmierci niemowląt w krajach zachodnich iw głównych miastach Chin. Istnieje wiele różnych rodzajów wrodzonych wad rozwojowych, a niektóre z nich mogą być spowodowane zmianami w mutacjach genów. Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) to wysokowydajne sekwencjonowanie równoległe, które może dostarczyć informacji genetycznych z dużą dokładnością. Jest to szybsza i tańsza metoda wykrywania mutacji genów w porównaniu z sekwencjonowaniem Sangera. Mamy nadzieję połączyć techniki genomiczne z bardziej tradycyjnymi metodami związanymi z odkrywaniem genów w celu zbadania szerokiego zakresu schorzeń, w przypadku których istnieją mocne dowody na udział czynników genetycznych. Tak więc w tym badaniu oceniliśmy kliniczną rolę testów NGS w kierunku chorób genetycznych noworodków u noworodków w porównaniu z sekwencjonowaniem Sangera, aby zaobserwować, czy ta nowa technologia może znacznie skrócić czas badania, poprawić wskaźnik diagnozy, ukierunkować leczenie interwencyjne i promować rokowanie.

Te noworodki, które mają niezdiagnozowaną chorobę i rodziny cząstkowe, będą kwalifikować się do udziału w badaniu. Badana populacja będzie rekrutowana z populacji szpitalnej Szpitala Dziecięcego Uniwersytetu Fudan, głównie z oddziału intensywnej terapii noworodków (NICU), z subpopulacją zgłaszającą się do innych szpitali w Chinach. Wszyscy uczestnicy badania, których to dotyczy, zostaną poddani badaniu genetycznemu zgodnie z ich objawami klinicznymi. Wszyscy uczestnicy zostaną pobrani z krwi w celu izolacji DNA i sekwencjonowania genomu w momencie włączenia do badania. Wszystkie objętości próbek krwi będą zgodne z procedurą Fudana dotyczącą maksymalnej ilości krwi u pacjentów pediatrycznych. Ponadto próbki płynu mózgowo-rdzeniowego i tkanek mogą być pobierane i przechowywane w banku biopróbek. DNA zostanie wyizolowane i przygotowane dla NGS lub Sanger z protokołami Fudan w Centrum Medycyny Translacyjnej Szpitala Dziecięcego Uniwersytetu Fudan. Uzyskane zostaną również częściowe próbki rodzinne, a kwasy nukleinowe zostaną również zsekwencjonowane, jak wskazano, aby pomóc w diagnozie choroby genetycznej u noworodka. Wszystkie dane sekwencjonowania będą przechowywane w biorepozytorium Centrum Genomu. W przypadku pozytywnych wyników badania, które mogą mieć charakter diagnostyczny, nasz badacz przeprowadzi potwierdzające kliniczne testy diagnostyczne, aw przypadku potwierdzenia, standardowy kliniczny raport diagnostyczny zostanie umieszczony w dokumentacji medycznej pacjenta. Kontakt z rodziną pacjenta będzie prowadzony przez zespół opieki klinicznej. Zarówno wyniki diagnozy molekularnej, jak i czas do postawienia diagnozy zostaną zapisane jako główne wyniki.

Ponadto informacje te pomogą złagodzić niepokój ze strony rodziny, a także zapewnią mechanizm przejścia pacjenta do ramienia szybkiego NGS, jeśli stan kliniczny pacjenta ulegnie pogorszeniu i na prośbę zespołu opieki klinicznej. Za każdym razem, gdy uczestnik badania jest zapisywany, lekarz i rodzice zostaną poproszeni o wypełnienie ankiety przed badaniem NGS i po otrzymaniu wyników. Przeanalizujemy również dokumentację medyczną pacjenta i zbierzemy zmienne kliniczne, w tym badania laboratoryjne, wyniki radiologii, leki i inne otrzymane zabiegi, aby dalej analizować wpływ NGS na opiekę kliniczną. Tak więc ostatecznym celem jest zindywidualizowana lub spersonalizowana terapia. Planujemy corocznie kontaktować się z rodzinami do 18 miesięcy po rejestracji i rejestrować wyniki kliniczne związane z tym badaniem.