新生児集中治療室における先天性欠損症のゲノム配列決定と個別化された治療
調査の概要
詳細な説明
新生児の先天性奇形は、西側世界および中国の主要都市における乳児死亡の最も頻繁な原因の1つです。 先天性奇形にはさまざまな種類があり、そのうちのいくつかは遺伝子変異の変化によって引き起こされる可能性があります。 次世代シーケンシング (NGS) は、遺伝情報を高精度で提供できるハイスループットの並列シーケンシングです。 サンガーシーケンシングと比較して、遺伝子変異を検出するためのより高速で費用対効果の高い方法です。 遺伝的要因が関与しているという強力な証拠がある幅広い条件を調査するために、ゲノム技術を遺伝的発見に関与するより伝統的な方法と組み合わせたいと考えています。 そのため、この研究では、新生児の新生児遺伝病に対する NGS 検査の臨床的役割をサンガー シーケンスと比較して評価し、この新しい技術が検査時間を大幅に短縮し、診断率を改善し、介入治療を導き、予後を促進できるかどうかを観察しました。
診断されていない病気を患っているこれらの新生児、および部分的な家族は、研究に参加する資格があります。 研究集団は、復旦大学の小児病院の入院患者集団、主に新生児集中治療室(NICU)から募集され、サブ集団は中国の他の病院に提示されます。 影響を受けるすべての研究参加者は、臨床症状に応じて遺伝子スクリーニングを受けます。 すべての被験者は、研究への登録時にDNA分離とゲノム配列決定のために採血されます。 すべての血液サンプル量は、小児患者の最大血液に関する復旦手順に従います。 さらに、脳脊髄液および組織サンプルを収集し、バイオサンプルのバンクに保存することができる。 復旦大学の小児病院のトランスレーショナル メディスン センターで復旦プロトコルを使用して、DNA を分離し、NGS またはサンガー用に調製します。 新生児の遺伝病の診断を助けるために、示されているように、部分的な家族サンプルも得られ、核酸も配列決定される。 すべてのシーケンス データは、Genome Center Biorepository に保存されます。 診断に役立つ可能性のある陽性の研究結果が得られた場合、当社の治験責任医師は確認のための臨床診断検査を実施し、確認された場合は、標準的な臨床診断レポートが患者の医療記録に記録されます。 患者の家族とのフォローアップは、臨床ケアチームによって導かれます。 分子診断の結果と診断までの期間の両方が主要な結果として記録されます。
さらに、この情報は家族側の不安を軽減するのに役立ち、患者が臨床的に悪化している場合、および臨床ケアチームの要求に応じて、迅速な NGS アームへの患者のクロスオーバーのメカニズムも提供します。 研究参加者が登録されるたびに、臨床医と保護者は、NGS 検査の前と結果の返却後にアンケートに記入するよう求められます。 また、患者の医療記録を確認し、臨床検査、放射線検査の結果、投薬、その他の治療などの臨床変数を収集して、NGS が臨床ケアに与える影響をさらに分析します。 したがって、最終的な目標は、個別化または個別化された治療です。 登録後18か月まで毎年家族をフォローアップし、この研究に関連する臨床結果を記録する予定です。
研究の種類
入学 (予想される)
連絡先と場所
研究場所
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Shanghai
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Shanghai、Shanghai、中国
- 募集
- Children Hospital of Fudan University
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
健康ボランティアの受け入れ
受講資格のある性別
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
包含基準:
以下のいずれかの基準が必要です。
- -研究病院の1つの新生児集中治療室に入院した新生児
- 臨床遺伝子検査または遺伝子相談が注文されている
- 被験者は1つの主要な構造的異常、または3つ以上の軽微な異常を持っています
- 遺伝病を示唆する異常な臨床検査
- 主要な基礎疾患に対する標準治療に対する異常な反応
除外基準:
- 以前に患者に対してエクソーム/ゲノム配列決定を行った
- 臨床的考慮により1.0mlの採血ができない乳児
- 大きな染色体異常 (13、18、21 トリソミーまたはその他) の特徴を持っている
- 両親は、ゲノムレポートを医療記録に載せたり、かかりつけの小児科医に送ったりすることを望まない
- 親が同意を拒否
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 観測モデル:コホート
- 時間の展望:見込みのある
コホートと介入
グループ/コホート |
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先天性欠損症
新生児は、NICU でゲノム配列決定と個別化された治療を受けていた先天性欠損症と診断されました。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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死亡
時間枠:修正月齢18ヶ月
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各グループの死亡の相対頻度。
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修正月齢18ヶ月
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障害率
時間枠:修正月齢18ヶ月
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身体的または精神的なハンディキャップとして定義される障害。
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修正月齢18ヶ月
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遺伝子変異
時間枠:サンプル受領後30日以内
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突然変異を検出し、さまざまなゲノム手法を使用して、新生児奇形の遺伝的構造とリスクバリアントを特徴付けます。
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サンプル受領後30日以内
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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神経発達(ベイリースコア)
時間枠:修正月齢18ヶ月
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Bayley Scores of Infant Development Mental Development Index (MDI) によって神経発達機能を評価するには、MDI < 70 (重度) または MDI < 85 (中程度) の発生率を獲得します。
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修正月齢18ヶ月
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呼吸サポート
時間枠:結果開示後14日以内
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結果の開示後に臨床モニタリングが変更されるかどうかを観察する
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結果開示後14日以内
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ケアレベル
時間枠:結果開示後14日以内
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結果開示後に要介護度が変わるかどうかを観察するため
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結果開示後14日以内
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その他の成果指標
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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入院費用の総額
時間枠:修正月齢18ヶ月
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両腕の病院料金における医療資源の利用率の決定。
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修正月齢18ヶ月
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平均入院日数
時間枠:修正月齢18ヶ月
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入院から退院まで。
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修正月齢18ヶ月
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研究結果に対する保護者の理解
時間枠:修正月齢3ヶ月
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評価する質問を介して保護者アンケートで評価: 主観的な理解、理解の重要性。
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修正月齢3ヶ月
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研究結果に対する両親の想起
時間枠:修正月齢3ヶ月
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質問評価による保護者アンケートでの評価: 結果のリコール
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修正月齢3ヶ月
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協力者と研究者
協力者
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Viggiano E, Marabotti A, Burlina AP, Cazzorla C, D'Apice MR, Giordano L, Fasan I, Novelli G, Facchiano A, Burlina AB. Clinical and molecular spectra in galactosemic patients from neonatal screening in northeastern Italy: structural and functional characterization of new variations in the galactose-1-phosphate uridyltransferase (GALT) gene. Gene. 2015 Apr 1;559(2):112-8. doi: 10.1016/j.gene.2015.01.013. Epub 2015 Jan 13.
- Yang D, Sun YY, Bhaumik SK, Li Y, Baumann JM, Lin X, Zhang Y, Lin SH, Dunn RS, Liu CY, Shie FS, Lee YH, Wills-Karp M, Chougnet CA, Kallapur SG, Lewkowich IP, Lindquist DM, Murali-Krishna K, Kuan CY. Blocking lymphocyte trafficking with FTY720 prevents inflammation-sensitized hypoxic-ischemic brain injury in newborns. J Neurosci. 2014 Dec 3;34(49):16467-81. doi: 10.1523/JNEUROSCI.2582-14.2014.
- Scully MA, Farrell PM, Ciafaloni E, Griggs RC, Kwon JM. Cystic fibrosis newborn screening: a model for neuromuscular disease screening? Ann Neurol. 2015 Feb;77(2):189-97. doi: 10.1002/ana.24316. Epub 2014 Dec 13.
- Hamilton ST, van Zuylen W, Shand A, Scott GM, Naing Z, Hall B, Craig ME, Rawlinson WD. Prevention of congenital cytomegalovirus complications by maternal and neonatal treatments: a systematic review. Rev Med Virol. 2014 Nov;24(6):420-33. doi: 10.1002/rmv.1814. Epub 2014 Oct 14.
- Matic M, Simons SH, van Lingen RA, van Rosmalen J, Elens L, de Wildt SN, Tibboel D, van Schaik RH. Rescue morphine in mechanically ventilated newborns associated with combined OPRM1 and COMT genotype. Pharmacogenomics. 2014 Jul;15(10):1287-95. doi: 10.2217/pgs.14.100.
- Kwan A, Abraham RS, Currier R, Brower A, Andruszewski K, Abbott JK, Baker M, Ballow M, Bartoshesky LE, Bonilla FA, Brokopp C, Brooks E, Caggana M, Celestin J, Church JA, Comeau AM, Connelly JA, Cowan MJ, Cunningham-Rundles C, Dasu T, Dave N, De La Morena MT, Duffner U, Fong CT, Forbes L, Freedenberg D, Gelfand EW, Hale JE, Hanson IC, Hay BN, Hu D, Infante A, Johnson D, Kapoor N, Kay DM, Kohn DB, Lee R, Lehman H, Lin Z, Lorey F, Abdel-Mageed A, Manning A, McGhee S, Moore TB, Naides SJ, Notarangelo LD, Orange JS, Pai SY, Porteus M, Rodriguez R, Romberg N, Routes J, Ruehle M, Rubenstein A, Saavedra-Matiz CA, Scott G, Scott PM, Secord E, Seroogy C, Shearer WT, Siegel S, Silvers SK, Stiehm ER, Sugerman RW, Sullivan JL, Tanksley S, Tierce ML 4th, Verbsky J, Vogel B, Walker R, Walkovich K, Walter JE, Wasserman RL, Watson MS, Weinberg GA, Weiner LB, Wood H, Yates AB, Puck JM, Bonagura VR. Newborn screening for severe combined immunodeficiency in 11 screening programs in the United States. JAMA. 2014 Aug 20;312(7):729-38. doi: 10.1001/jama.2014.9132. Erratum In: JAMA. 2014 Nov 26;312(20):2169. Bonagura, Vincent R [Added].
- Morrone A, Caciotti A, Atwood R, Davidson K, Du C, Francis-Lyon P, Harmatz P, Mealiffe M, Mooney S, Oron TR, Ryles A, Zawadzki KA, Miller N. Morquio A syndrome-associated mutations: a review of alterations in the GALNS gene and a new locus-specific database. Hum Mutat. 2014 Nov;35(11):1271-9. doi: 10.1002/humu.22635. Epub 2014 Sep 17.
- Mercimek-Mahmutoglu S, Cordeiro D, Cruz V, Hyland K, Struys EA, Kyriakopoulou L, Mamak E. Novel therapy for pyridoxine dependent epilepsy due to ALDH7A1 genetic defect: L-arginine supplementation alternative to lysine-restricted diet. Eur J Paediatr Neurol. 2014 Nov;18(6):741-6. doi: 10.1016/j.ejpn.2014.07.001. Epub 2014 Jul 27.
- Eldar-Geva T, Srebnik N, Altarescu G, Varshaver I, Brooks B, Levy-Lahad E, Bromiker R, Schimmel MS. Neonatal outcome after preimplantation genetic diagnosis. Fertil Steril. 2014 Oct;102(4):1016-21. doi: 10.1016/j.fertnstert.2014.06.023. Epub 2014 Jul 23.
- Chen X, Yan K, Gao Y, Wang H, Chen G, Wu B, Qin Q, Yang L, Zhou W. Feeding difficulty is the dominant feature in 12 Chinese newborns with CHD7 pathogenic variants. BMC Med Genet. 2019 May 30;20(1):93. doi: 10.1186/s12881-019-0813-z.
便利なリンク
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研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (予想される)
研究の完了 (予想される)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (見積もり)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- CHFudanU_NNICU2
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