Genomisk sekvensering och personlig behandling för fosterskador på neonatala intensivvårdsavdelningar

Neonatala medfödda missbildningar är en av de vanligaste orsakerna till spädbarnsdöd i västvärlden och större städer i Kina. Det finns många olika typer av medfödda missbildningar, och en del av dessa kan orsakas av förändringar i genmutationer. Nästa generations sekvensering (NGS) är en parallell sekvensering med hög genomströmning som kan ge genetisk information med hög noggrannhet. Det är en snabbare och kostnadseffektiv metod för att upptäcka genmutationer jämfört med Sanger-sekvensering. Vi hoppas kunna koppla genomiska tekniker med mer traditionella metoder involverade i genetisk upptäckt för att undersöka ett brett spektrum av tillstånd för vilka det finns starka bevis för att genetiska faktorer är inblandade. Så i den här studien utvärderade vi den kliniska rollen av NGS-testning för neonatal genetisk sjukdom hos nyfödda jämfört med Sanger-sekvensering för att observera om denna nya teknologi avsevärt kan förkorta undersökningstiden, förbättra diagnosfrekvensen, vägleda interventionsbehandlingarna och främja prognos.

Dessa nyfödda som har en odiagnostiserad sjukdom, och delvis familjer, kommer att vara berättigade att delta i studien. Studiepopulationen kommer att rekryteras från barnsjukhuset vid Fudan Universitys slutenvårdspopulation, i första hand neonatal intensivvårdsavdelning (NICU), med en subpopulation som kommer till andra sjukhus i Kina. Alla berörda studiedeltagare kommer att få en genetisk screening enligt deras kliniska symptom. Alla försökspersoner kommer att få blod uttaget för DNA-isolering och genomisk sekvensering vid tidpunkten för registreringen i studien. Alla blodprovsvolymer kommer att följa Fudan-proceduren för maximalt blodvärde hos pediatriska patienter. Dessutom kan cerebrospinalvätska och vävnadsprover samlas in och lagras i bioprovbanken. DNA kommer att isoleras och förberedas för NGS eller Sanger med Fudan-protokoll vid Translational Medicine Center på Barnsjukhuset vid Fudan University. Partiella familjeprover kommer också att erhållas, och nukleinsyror kommer också att sekvenseras, såsom indikeras, för att hjälpa till vid diagnos av den genetiska sjukdomen hos det nyfödda barnet. All sekvenseringsdata kommer att lagras i Genome Center Biorepository. I fallet med positiva studiefynd som kan vara diagnostiska kommer vår utredare att utföra bekräftande kliniska diagnostiska tester och, om det bekräftas, kommer en vanlig klinisk diagnostisk rapport att placeras i patientens journal. Uppföljning med patientens familj kommer att vägledas av det kliniska vårdteamet. Både resultat av molekylära diagnoser och varaktighet till diagnos kommer att registreras som primära resultat.

Dessutom kommer denna information att hjälpa till att lindra oro hos familjen, och tillhandahåller också en mekanism för patientövergång till den snabba NGS-armen om patienten försämras kliniskt, och på det kliniska vårdteamets begäran. Varje gång en studiedeltagare registreras kommer läkaren och föräldrarna att bli ombedda att fylla i en enkät innan NGS-testning och efter återlämnande av resultat. Vi kommer också att granska patientens journal och samla in kliniska variabler inklusive laboratorietester, röntgenresultat, mediciner och andra mottagna behandlingar för att ytterligare analysera effekten NGS har på den kliniska vården. Så det slutliga målet är individualiserad eller personlig terapi. Vi planerar att följa upp familjer årligen upp till 18 månader efter inskrivningen och registrera kliniska resultat relaterade till denna studie.