Sequenciamento genômico e tratamento personalizado para defeitos congênitos em unidades de terapia intensiva neonatal

A malformação congênita neonatal é uma das causas mais frequentes de morte infantil no mundo ocidental e nas principais cidades da China. Existem muitos tipos diferentes de malformações congênitas, e algumas delas podem ser causadas por alterações na mutação genética. O sequenciamento de próxima geração (NGS) é um sequenciamento paralelo de alto rendimento que pode fornecer informações genéticas com alta precisão. É um método mais rápido e econômico para detectar mutações genéticas em comparação com o sequenciamento de Sanger. Esperamos combinar técnicas genômicas com métodos mais tradicionais envolvidos na descoberta genética, a fim de investigar uma ampla gama de condições para as quais há fortes evidências de que fatores genéticos estão envolvidos. Portanto, neste estudo, avaliamos o papel clínico do teste NGS para doenças genéticas neonatais em recém-nascidos em comparação com o sequenciamento de Sanger para observar se essa nova tecnologia pode reduzir significativamente o tempo de exame, melhorar a taxa de diagnóstico, orientar os tratamentos de intervenção e promover o prognóstico.

Esses recém-nascidos que têm uma doença não diagnosticada e famílias parciais serão elegíveis para participar do estudo. A população do estudo será recrutada na população internada do Hospital Infantil da Universidade de Fudan, principalmente na unidade de terapia intensiva neonatal (UTIN), com uma subpopulação que se apresenta em outros hospitais na China. Todos os participantes do estudo afetados receberão uma triagem genética de acordo com seu sintoma clínico. Todos os indivíduos terão sangue coletado para isolamento de DNA e sequenciamento genômico no momento da inscrição no estudo. Todos os volumes de amostra de sangue irão aderir ao procedimento Fudan em sangue máximo em pacientes pediátricos. Além disso, amostras de líquido cefalorraquidiano e tecido podem ser coletadas e armazenadas no banco de bioamostras. O DNA será isolado e preparado para protocolos NGS ou Sanger com Fudan no Centro de Medicina Translacional do Hospital Infantil da Universidade de Fudan. Amostras familiares parciais também serão obtidas e os ácidos nucléicos também serão sequenciados, conforme indicado, para auxiliar no diagnóstico da doença genética no recém-nascido. Todos os dados de sequenciamento serão armazenados no Biorepositório do Centro de Genoma. No caso de resultados positivos do estudo que possam ser diagnósticos, nosso investigador realizará testes de diagnóstico clínico confirmatórios e, se confirmado, um relatório de diagnóstico clínico padrão será colocado no prontuário médico do paciente. O acompanhamento com a família do paciente será orientado pela equipe de atendimento clínico. Os resultados dos diagnósticos moleculares e a duração do diagnóstico serão registrados como resultados primários.

Além disso, essas informações ajudarão a aliviar a ansiedade da família e também fornecerão um mecanismo para o paciente passar para o braço NGS rápido se o paciente estiver se deteriorando clinicamente e a pedido da equipe de atendimento clínico. Cada vez que um participante do estudo é inscrito, o clínico e os pais serão solicitados a preencher uma pesquisa antes do teste NGS e após o retorno dos resultados. Também revisaremos o registro médico do paciente e coletaremos variáveis ​​clínicas, incluindo testes laboratoriais, resultados de radiologia, medicamentos e outros tratamentos recebidos para analisar melhor o efeito que o NGS tem no atendimento clínico. Portanto, o objetivo final é a terapia individualizada ou personalizada. Planejamos acompanhar as famílias anualmente até 18 meses após a inscrição e registrar os resultados clínicos relacionados a este estudo.