Séquençage génomique et traitement personnalisé des malformations congénitales dans les unités de soins intensifs néonatals

La malformation congénitale néonatale est l'une des causes les plus fréquentes de mortalité infantile dans le monde occidental et les grandes villes de Chine. Il existe de nombreux types de malformations congénitales, et certaines d'entre elles peuvent être causées par des changements dans la mutation génétique. Le séquençage de nouvelle génération (NGS) est un séquençage parallèle à haut débit qui peut fournir des informations génétiques avec une grande précision. Il s'agit d'une méthode plus rapide et plus économique pour détecter les mutations génétiques par rapport au séquençage Sanger. Nous espérons coupler des techniques génomiques avec des méthodes plus traditionnelles impliquées dans la découverte génétique afin d'étudier un large éventail de conditions pour lesquelles il existe des preuves solides que des facteurs génétiques sont impliqués. Ainsi, dans cette étude, nous avons évalué le rôle clinique du test NGS pour les maladies génétiques néonatales chez les nouveau-nés par rapport au séquençage Sanger afin d'observer si cette nouvelle technologie peut réduire considérablement le temps d'examen, améliorer le taux de diagnostic, guider les traitements d'intervention et favoriser le pronostic.

Ces nouveau-nés qui ont une maladie non diagnostiquée et les familles partielles seront éligibles pour participer à l'étude. La population à l'étude sera recrutée parmi les patients hospitalisés de l'Hôpital pour enfants de l'Université de Fudan, principalement l'unité de soins intensifs néonatals (USIN), avec une sous-population se présentant dans d'autres hôpitaux en Chine. Tous les participants à l'étude concernés recevront un dépistage génétique en fonction de leurs symptômes cliniques. Tous les sujets subiront une prise de sang pour l'isolement de l'ADN et le séquençage génomique au moment de l'inscription à l'étude. Tous les volumes d'échantillons de sang respecteront la procédure de Fudan sur le sang maximum chez les patients pédiatriques. De plus, des échantillons de liquide céphalo-rachidien et de tissus peuvent être prélevés et conservés dans la banque d'échantillons biologiques. L'ADN sera isolé et préparé pour les protocoles NGS ou Sanger avec Fudan au Centre de médecine translationnelle de l'Hôpital pour enfants de l'Université de Fudan. Des échantillons familiaux partiels seront également obtenus et les acides nucléiques seront également séquencés, comme indiqué, pour aider au diagnostic de la maladie génétique chez le nouveau-né. Toutes les données de séquençage seront stockées dans le biodépôt du centre de génomique. Dans le cas de résultats d'étude positifs pouvant être diagnostiques, notre investigateur effectuera des tests de diagnostic clinique de confirmation et, s'ils sont confirmés, un rapport de diagnostic clinique standard sera placé dans le dossier médical du patient. Le suivi avec la famille du patient sera guidé par l'équipe de soins cliniques. Les résultats des diagnostics moléculaires et la durée du diagnostic seront enregistrés comme résultats principaux.

De plus, ces informations aideront à atténuer l'anxiété de la part de la famille et fourniront également un mécanisme de passage du patient dans le bras NGS rapide si le patient se détériore cliniquement et à la demande de l'équipe de soins cliniques. Chaque fois qu'un participant à l'étude est inscrit, le clinicien et les parents seront invités à remplir un sondage avant le test NGS et après le retour des résultats. Nous examinerons également le dossier médical du patient et collecterons des variables cliniques, notamment des tests de laboratoire, des résultats de radiologie, des médicaments et d'autres traitements reçus pour analyser plus en détail l'effet du NGS sur les soins cliniques. Le but ultime est donc une thérapie individualisée ou personnalisée. Nous prévoyons de suivre les familles chaque année jusqu'à 18 mois après l'inscription et d'enregistrer les résultats cliniques liés à cette étude.