Sequenziamento genomico e trattamento personalizzato dei difetti congeniti nelle unità di terapia intensiva neonatale

La malformazione congenita neonatale è una delle più frequenti cause di morte infantile nel mondo occidentale e nelle principali città della Cina. Esistono molti tipi diversi di malformazioni congenite e alcune di queste possono essere causate da cambiamenti nella mutazione genetica. Il sequenziamento di nuova generazione (NGS) è un sequenziamento parallelo ad alto rendimento in grado di fornire informazioni genetiche con elevata precisione. È un metodo più rapido ed economico per rilevare le mutazioni geniche rispetto al sequenziamento di Sanger. Speriamo di accoppiare le tecniche genomiche con metodi più tradizionali coinvolti nella scoperta genetica al fine di indagare su un'ampia gamma di condizioni per le quali vi è una forte evidenza che siano coinvolti fattori genetici. Quindi, in questo studio, abbiamo valutato il ruolo clinico del test NGS per la malattia genetica neonatale nei neonati rispetto al sequenziamento di Sanger per osservare se questa nuova tecnologia può ridurre significativamente il tempo dell'esame, migliorare il tasso di diagnosi, guidare i trattamenti di intervento e promuovere la prognosi.

Questi neonati che hanno una malattia non diagnosticata e famiglie parziali potranno partecipare allo studio. La popolazione dello studio sarà reclutata dalla popolazione ospedaliera dell'ospedale pediatrico dell'Università di Fudan, principalmente l'unità di terapia intensiva neonatale (NICU), con una sottopopolazione che si presenterà ad altri ospedali in Cina. Tutti i partecipanti allo studio interessati riceveranno uno screening genetico in base al loro sintomo clinico. A tutti i soggetti verrà prelevato il sangue per l'isolamento del DNA e il sequenziamento genomico al momento dell'arruolamento nello studio. Tutti i volumi dei campioni di sangue aderiranno alla procedura Fudan sul sangue massimo nei pazienti pediatrici. Inoltre, i campioni di liquido cerebrospinale e di tessuto possono essere raccolti e conservati nella banca dei campioni biologici. Il DNA sarà isolato e preparato per i protocolli NGS o Sanger con Fudan presso il Translational Medicine Center of Children's Hospital dell'Università di Fudan. Verranno inoltre ottenuti campioni familiari parziali e sequenziati gli acidi nucleici, come indicato, per assistere nella diagnosi della malattia genetica nel neonato. Tutti i dati di sequenziamento verranno archiviati nel Genome Center Biorepository. In caso di risultati positivi dello studio che possono essere diagnostici, il nostro investigatore eseguirà test diagnostici clinici di conferma e, se confermato, un rapporto diagnostico clinico standard verrà inserito nella cartella clinica del paziente. Il follow-up con la famiglia del paziente sarà guidato dal team di assistenza clinica. Entrambi i risultati delle diagnosi molecolari e la durata della diagnosi saranno registrati come risultati primari.

Inoltre, queste informazioni contribuiranno ad alleviare l'ansia da parte della famiglia e forniranno anche un meccanismo per il passaggio del paziente al braccio NGS rapido se il paziente sta peggiorando clinicamente e su richiesta del team di assistenza clinica. Ogni volta che viene arruolato un partecipante allo studio, al medico e ai genitori verrà chiesto di compilare un sondaggio prima del test NGS e dopo la restituzione dei risultati. Esamineremo anche la cartella clinica del paziente e raccoglieremo variabili cliniche tra cui test di laboratorio, risultati radiologici, farmaci e altri trattamenti ricevuti per analizzare ulteriormente l'effetto che NGS ha sulla cura clinica. Quindi l'obiettivo finale è una terapia individualizzata o personalizzata. Abbiamo in programma di seguire le famiglie ogni anno fino a 18 mesi dopo l'arruolamento e registrare i risultati clinici relativi a questo studio.