Secuenciación Genómica y Tratamiento Personalizado de Defectos Congénitos en Unidades de Cuidados Intensivos Neonatales

La malformación congénita neonatal es una de las causas más frecuentes de muerte infantil en el mundo occidental y en las principales ciudades de China. Hay muchos tipos diferentes de malformaciones congénitas, y algunas de ellas pueden ser causadas por cambios en la mutación genética. La secuenciación de próxima generación (NGS) es una secuenciación paralela de alto rendimiento que puede proporcionar información genética con gran precisión. Es un método más rápido y rentable para detectar mutaciones genéticas en comparación con la secuenciación de Sanger. Esperamos unir las técnicas genómicas con métodos más tradicionales involucrados en el descubrimiento genético para investigar una amplia gama de condiciones para las cuales existe una fuerte evidencia de que los factores genéticos están involucrados. Entonces, en este estudio, evaluamos el papel clínico de las pruebas de NGS para enfermedades genéticas neonatales en recién nacidos en comparación con la secuenciación de Sanger para observar si esta nueva tecnología puede acortar significativamente el tiempo de examen, mejorar la tasa de diagnóstico, guiar los tratamientos de intervención y promover el pronóstico.

Estos recién nacidos que tienen una enfermedad no diagnosticada y familias parciales serán elegibles para participar en el estudio. La población del estudio se reclutará de la población de pacientes hospitalizados del Children's Hospital of Fudan University, principalmente de la unidad de cuidados intensivos neonatales (UCIN), con una subpoblación que se presentará en otros hospitales de China. Todos los participantes del estudio afectados recibirán un cribado genético según su síntoma clínico. A todos los sujetos se les extraerá sangre para el aislamiento del ADN y la secuenciación genómica en el momento de la inscripción en el estudio. Todos los volúmenes de muestra de sangre se adherirán al procedimiento de Fudan sobre sangre máxima en pacientes pediátricos. Además, las muestras de tejido y líquido cefalorraquídeo pueden recogerse y almacenarse en el banco de muestras biológicas. El ADN se aislará y preparará para NGS o Sanger con los protocolos de Fudan en el Centro de Medicina Traslacional del Hospital Infantil de la Universidad de Fudan. También se obtendrán muestras familiares parciales y se secuenciarán los ácidos nucleicos, según se indica, para ayudar en el diagnóstico de la enfermedad genética en el recién nacido. Todos los datos de secuenciación se almacenarán en el Biorepositorio del Genome Center. En el caso de resultados positivos del estudio que puedan ser diagnósticos, nuestro investigador realizará pruebas de diagnóstico clínico de confirmación y, si se confirma, se colocará un informe de diagnóstico clínico estándar en el expediente médico del paciente. El seguimiento con la familia del paciente será guiado por el equipo de atención clínica. Tanto los resultados de los diagnósticos moleculares como la duración hasta el diagnóstico se registrarán como resultados primarios.

Además, esta información ayudará a aliviar la ansiedad por parte de la familia y también proporciona un mecanismo para el cruce del paciente al brazo de NGS rápido si el paciente se está deteriorando clínicamente y a pedido del equipo de atención clínica. Cada vez que se inscriba un participante en el estudio, se les pedirá al médico y a los padres que completen una encuesta antes de la prueba NGS y después de la devolución de los resultados. También revisaremos el historial médico del paciente y recopilaremos variables clínicas, incluidas pruebas de laboratorio, resultados de radiología, medicamentos y otros tratamientos recibidos para analizar más a fondo el efecto que tiene la NGS en la atención clínica. Por lo que el objetivo final es la terapia individualizada o personalizada. Planeamos hacer un seguimiento con las familias anualmente hasta 18 meses después de la inscripción y registrar los resultados clínicos relacionados con este estudio.