Геномное секвенирование и персонализированное лечение врожденных дефектов в отделениях интенсивной терапии новорожденных

Врожденные пороки развития новорожденных являются одной из наиболее частых причин младенческой смертности в западном мире и крупных городах Китая. Существует множество различных типов врожденных пороков развития, и некоторые из них могут быть вызваны изменениями в генных мутациях. Секвенирование следующего поколения (NGS) — это высокопроизводительное параллельное секвенирование, которое может предоставить генетическую информацию с высокой точностью. Это более быстрый и экономичный метод обнаружения генных мутаций по сравнению с секвенированием по Сэнгеру. Мы надеемся объединить геномные методы с более традиционными методами, связанными с генетическими открытиями, чтобы исследовать широкий спектр состояний, для которых есть убедительные доказательства участия генетических факторов. Итак, в этом исследовании мы оценили клиническую роль NGS-тестирования на неонатальные генетические заболевания у новорожденных по сравнению с секвенированием по Сэнгеру, чтобы выяснить, может ли эта новая технология значительно сократить время обследования, улучшить частоту диагностики, направить интервенционное лечение и улучшить прогноз.

Эти новорожденные с невыявленным заболеванием и неполные семьи будут иметь право участвовать в исследовании. Исследуемая популяция будет набрана из стационарного населения Детской больницы Университета Фудань, в первую очередь из отделения интенсивной терапии новорожденных (ОИТН), а подгруппа будет представлена ​​​​в других больницах Китая. Все затронутые участники исследования пройдут генетический скрининг в соответствии с их клиническими симптомами. У всех субъектов будет взята кровь для выделения ДНК и секвенирования генома во время регистрации в исследовании. Все объемы образцов крови будут соответствовать процедуре Фудань для максимального количества крови у педиатрических пациентов. Кроме того, образцы спинномозговой жидкости и тканей могут быть собраны и сохранены в банке биообразцов. ДНК будет выделена и подготовлена ​​для NGS или Sanger с протоколами Fudan в Центре трансляционной медицины детской больницы Фуданьского университета. Также будут получены частичные семейные образцы, а нуклеиновые кислоты также будут секвенированы, как указано, чтобы помочь в диагностике генетического заболевания у новорожденного. Все данные секвенирования будут храниться в биорепозитории Genome Center. В случае положительных результатов исследования, которые могут быть диагностическими, наш исследователь проведет подтверждающее клиническое диагностическое тестирование, и в случае подтверждения в медицинскую карту пациента будет помещен стандартный клинический диагностический отчет. Последующее общение с семьей пациента будет осуществляться под руководством клинической бригады. Как результаты молекулярной диагностики, так и продолжительность постановки диагноза будут регистрироваться как первичные исходы.

Кроме того, эта информация поможет уменьшить тревогу со стороны семьи, а также обеспечит механизм перехода пациента в группу быстрого NGS, если состояние пациента ухудшается, а также по запросу бригады клинической помощи. Каждый раз, когда участник исследования зачисляется, врачу и родителям будет предложено заполнить анкету до тестирования NGS и после получения результатов. Мы также изучим медицинскую карту пациента и соберем клинические переменные, включая лабораторные анализы, результаты радиологии, лекарства и другое лечение, чтобы дополнительно проанализировать влияние NGS на клиническую помощь. Таким образом, конечной целью является индивидуализированная или персонифицированная терапия. Мы планируем ежегодно наблюдать за семьями в течение 18 месяцев после регистрации и регистрировать клинические результаты, связанные с этим исследованием.