Genomische Sequenzierung und personalisierte Behandlung von Geburtsfehlern auf Neugeborenen-Intensivstationen

Angeborene Missbildungen bei Neugeborenen sind eine der häufigsten Todesursachen bei Säuglingen in der westlichen Welt und in den großen Städten Chinas. Es gibt viele verschiedene Arten von angeborenen Fehlbildungen, und einige davon können durch Veränderungen in der Genmutation verursacht werden. Next Generation Sequencing (NGS) ist eine parallele Hochdurchsatz-Sequenzierung, die genetische Informationen mit hoher Genauigkeit liefern kann. Es ist eine schnellere und kostengünstigere Methode zum Nachweis von Genmutationen im Vergleich zur Sanger-Sequenzierung. Wir hoffen, genomische Techniken mit traditionelleren Methoden der genetischen Entdeckung zu koppeln, um ein breites Spektrum von Erkrankungen zu untersuchen, bei denen es starke Hinweise darauf gibt, dass genetische Faktoren beteiligt sind. Daher haben wir in dieser Studie die klinische Rolle von NGS-Tests für neonatale genetische Erkrankungen bei Neugeborenen im Vergleich zur Sanger-Sequenzierung bewertet, um zu beobachten, ob diese neue Technologie die Untersuchungszeit erheblich verkürzen, die Diagnoserate verbessern, die Interventionsbehandlungen steuern und die Prognose verbessern kann.

Diese Neugeborenen mit einer nicht diagnostizierten Krankheit und Teilfamilien sind zur Teilnahme an der Studie berechtigt. Die Studienpopulation wird aus der stationären Population des Kinderkrankenhauses der Fudan-Universität rekrutiert, in erster Linie der Intensivstation für Neugeborene (NICU), wobei eine Teilpopulation in anderen Krankenhäusern in China vorstellig wird. Alle betroffenen Studienteilnehmer erhalten ein genetisches Screening entsprechend ihrer klinischen Symptomatik. Allen Probanden wird zum Zeitpunkt der Aufnahme in die Studie Blut zur DNA-Isolierung und Genomsequenzierung entnommen. Alle Blutprobenvolumina entsprechen dem Fudan-Verfahren zur maximalen Blutentnahme bei pädiatrischen Patienten. Darüber hinaus können Liquor- und Gewebeproben entnommen und in der Bioprobenbank gelagert werden. DNA wird isoliert und für NGS oder Sanger mit Fudan-Protokollen im Translational Medicine Center des Kinderkrankenhauses der Fudan-Universität vorbereitet. Es werden auch Teilproben der Familie entnommen, und Nukleinsäuren werden, wie angegeben, ebenfalls sequenziert, um die Diagnose der genetischen Erkrankung beim Neugeborenen zu unterstützen. Alle Sequenzierungsdaten werden im Genome Center Biorepository gespeichert. Im Falle positiver Studienergebnisse, die diagnostisch sein können, führt unser Prüfarzt bestätigende klinische Diagnosetests durch, und wenn dies bestätigt wird, wird ein klinischer Standarddiagnosebericht in die Krankenakte des Patienten aufgenommen. Die Nachsorge bei der Familie des Patienten wird vom klinischen Betreuungsteam geleitet. Sowohl die Ergebnisse der molekularen Diagnose als auch die Dauer bis zur Diagnose werden als primäre Endpunkte erfasst.

Darüber hinaus tragen diese Informationen dazu bei, Ängste seitens der Familie zu lindern, und bieten auch einen Mechanismus für den Wechsel des Patienten in den Arm mit schneller NGS, wenn sich der Patient klinisch verschlechtert, und auf Wunsch des klinischen Behandlungsteams. Jedes Mal, wenn ein Studienteilnehmer aufgenommen wird, werden der Arzt und die Eltern gebeten, vor dem NGS-Test und nach der Übermittlung der Ergebnisse einen Fragebogen auszufüllen. Wir werden auch die Krankenakte des Patienten überprüfen und klinische Variablen sammeln, darunter Labortests, radiologische Ergebnisse, Medikamente und andere erhaltene Behandlungen, um die Auswirkungen von NGS auf die klinische Versorgung weiter zu analysieren. Das ultimative Ziel ist also eine individualisierte oder personalisierte Therapie. Wir planen, die Familien bis zu 18 Monate nach der Aufnahme jährlich nachzuverfolgen und klinische Ergebnisse im Zusammenhang mit dieser Studie aufzuzeichnen.