Genomische sequencing en gepersonaliseerde behandeling van geboorteafwijkingen op neonatale intensive care-afdelingen

Aangeboren misvormingen bij pasgeborenen is een van de meest voorkomende doodsoorzaken in de westerse wereld en in de grote steden van China. Er zijn veel verschillende soorten aangeboren afwijkingen en sommige kunnen worden veroorzaakt door veranderingen in genmutatie. Next Generation Sequencing (NGS) is een high-throughput parallelle sequencing die genetische informatie met hoge nauwkeurigheid kan leveren. Het is een snellere en kosteneffectieve methode om genmutaties te detecteren in vergelijking met Sanger-sequencing. We hopen genomische technieken te koppelen aan meer traditionele methoden die betrokken zijn bij genetische ontdekking, om een ​​breed scala aan aandoeningen te onderzoeken waarvoor er sterke aanwijzingen zijn dat er genetische factoren bij betrokken zijn. Dus in deze studie evalueerden we de klinische rol van NGS-testen voor neonatale genetische ziekte bij pasgeborenen in vergelijking met Sanger-sequencing om te observeren of deze nieuwe technologie de onderzoekstijd aanzienlijk kan verkorten, het diagnosepercentage kan verbeteren, de interventiebehandelingen kan begeleiden en de prognose kan bevorderen.

Deze pasgeborenen met een niet-gediagnosticeerde ziekte en gedeeltelijke gezinnen komen in aanmerking voor deelname aan het onderzoek. De onderzoekspopulatie zal worden gerekruteerd uit de intramurale populatie van het kinderziekenhuis van de Fudan-universiteit, voornamelijk de neonatale intensive care-afdeling (NICU), met een subpopulatie die zich presenteert in andere ziekenhuizen in China. Alle getroffen studiedeelnemers zullen een genetische screening ondergaan op basis van hun klinische symptomen. Bij alle proefpersonen wordt bloed afgenomen voor DNA-isolatie en genomische sequentiëring op het moment van deelname aan het onderzoek. Alle bloedmonstervolumes zullen voldoen aan de Fudan-procedure voor maximaal bloed bij pediatrische patiënten. Bovendien kunnen cerebrospinale vloeistof- en weefselmonsters worden verzameld en opgeslagen in de bank met biosamples. DNA zal worden geïsoleerd en voorbereid voor NGS of Sanger met Fudan-protocollen in het Translational Medicine Center van het kinderziekenhuis van de Fudan-universiteit. Gedeeltelijke familiale monsters zullen ook worden verkregen en de nucleïnezuren zullen ook worden gesequenced, zoals aangegeven, om te helpen bij de diagnose van de genetische ziekte bij de pasgeborene. Alle sequentiegegevens worden opgeslagen in de Genome Center Biorepository. In het geval van positieve onderzoeksbevindingen die diagnostisch kunnen zijn, zal onze onderzoeker bevestigende klinische diagnostische tests uitvoeren en, indien bevestigd, zal een standaard klinisch diagnostisch rapport in het medisch dossier van de patiënt worden geplaatst. Follow-up met de familie van de patiënt zal worden begeleid door het klinische zorgteam. Zowel de resultaten van de moleculaire diagnose als de duur tot de diagnose worden geregistreerd als primaire uitkomsten.

Bovendien helpt deze informatie de angst bij de familie te verlichten en biedt het ook een mechanisme voor de overgang van de patiënt naar de snelle NGS-arm als de patiënt klinisch achteruitgaat, en op verzoek van het klinische zorgteam. Elke keer dat een deelnemer aan het onderzoek wordt ingeschreven, wordt de clinicus en ouders gevraagd een enquête in te vullen voorafgaand aan de NGS-test en na teruggave van de resultaten. We zullen ook het medisch dossier van de patiënt bekijken en klinische variabelen verzamelen, waaronder laboratoriumtests, radiologieresultaten, medicijnen en andere ontvangen behandelingen om het effect van NGS op de klinische zorg verder te analyseren. Het uiteindelijke doel is dus geïndividualiseerde of gepersonaliseerde therapie. We zijn van plan om tot 18 maanden na inschrijving jaarlijks contact op te nemen met families en de klinische resultaten met betrekking tot deze studie vast te leggen.