Genomické sekvenování a personalizovaná léčba vrozených vad na jednotkách intenzivní péče pro novorozence

Novorozenecká vrozená malformace je jednou z nejčastějších příčin úmrtí kojenců v západním světě a velkých městech Číny. Existuje mnoho různých typů vrozených malformací a některé z nich mohou být způsobeny změnami v genové mutaci. Sekvenování nové generace (NGS) je vysoce výkonné paralelní sekvenování, které může poskytnout genetickou informaci s vysokou přesností. Je to rychlejší a nákladově efektivní metoda k detekci genových mutací ve srovnání se Sangerovým sekvenováním. Doufáme, že spojíme genomické techniky s tradičnějšími metodami zapojenými do genetického objevu, abychom prozkoumali širokou škálu stavů, u nichž existuje silný důkaz, že se na nich podílejí genetické faktory. V této studii jsme tedy hodnotili klinickou roli testování NGS na neonatální genetické onemocnění u novorozenců ve srovnání se Sangerovým sekvenováním, abychom zjistili, zda tato nová technologie může významně zkrátit dobu vyšetření, zlepšit míru diagnózy, vést intervenční léčbu a podpořit prognózu.

Tito novorozenci, kteří mají nediagnostikované onemocnění, a částečné rodiny se budou moci zúčastnit studie. Populace studie se bude rekrutovat z lůžkové populace Dětské nemocnice Fudanské univerzity, především z jednotky neonatální intenzivní péče (NICU), přičemž subpopulace bude přítomna v jiných nemocnicích v Číně. Všichni dotčení účastníci studie podstoupí genetický screening podle jejich klinického příznaku. Všem subjektům bude v době zařazení do studie odebrána krev pro izolaci DNA a genomové sekvenování. Všechny objemy vzorků krve budou odpovídat postupu Fudan pro maximální krev u dětských pacientů. Kromě toho lze vzorky mozkomíšního moku a tkáně odebírat a uchovávat v bance biologických vzorků. DNA bude izolována a připravena pro NGS nebo Sanger s protokoly Fudan v Centru translační medicíny Dětské nemocnice Fudanské univerzity. Budou také získány částečné familiární vzorky a budou také sekvenovány nukleové kyseliny, jak je uvedeno, aby se napomohlo diagnostice genetického onemocnění u novorozence. Všechna data sekvenování budou uložena v biorepozitáři Genome Center. V případě pozitivních nálezů studie, které mohou být diagnostické, náš zkoušející provede konfirmační klinické diagnostické testování a v případě potvrzení bude standardní klinická diagnostická zpráva vložena do zdravotnické dokumentace pacienta. Sledování s rodinou pacienta bude řízeno týmem klinické péče. Výsledky molekulární diagnózy a doba trvání diagnózy budou zaznamenány jako primární výsledky.

Kromě toho tyto informace pomohou zmírnit úzkost ze strany rodiny a také poskytují mechanismus pro přechod pacienta do ramene rychlého NGS, pokud se pacient klinicky zhoršuje, a na žádost týmu klinické péče. Pokaždé, když je účastník studie zapsán, bude lékař a rodiče požádáni o vyplnění průzkumu před testováním NGS a po vrácení výsledků. Zkontrolujeme také pacientovu lékařskou dokumentaci a shromáždíme klinické proměnné včetně laboratorních testů, radiologických výsledků, medikace a další přijaté léčby, abychom dále analyzovali účinek NGS na klinickou péči. Konečným cílem je tedy individuální nebo personalizovaná terapie. Plánujeme sledovat rodiny ročně až 18 měsíců po zařazení a zaznamenávat klinické výsledky související s touto studií.