Genominen sekvensointi ja yksilöllinen syntymävikojen hoito vastasyntyneiden tehohoitoyksiköissä

Vastasyntyneiden synnynnäinen epämuodostuma on yksi yleisimmistä lapsikuolemien syistä länsimaissa ja Kiinan suurissa kaupungeissa. Synnynnäisiä epämuodostumia on monia erilaisia, ja osa niistä voi johtua geenimutaatioiden muutoksista. Seuraavan sukupolven sekvensointi (NGS) on korkean suorituskyvyn rinnakkaissekvensointi, joka voi tarjota geneettistä tietoa suurella tarkkuudella. Se on nopeampi ja kustannustehokas menetelmä geenimutaatioiden havaitsemiseen verrattuna Sangerin sekvensointiin. Toivomme yhdistävämme genomitekniikat perinteisempiin geneettiseen löytöihin liittyviin menetelmiin tutkiaksemme monenlaisia ​​sairauksia, joissa on vahvaa näyttöä siitä, että geneettiset tekijät ovat mukana. Joten tässä tutkimuksessa arvioimme vastasyntyneiden geneettisen sairauden NGS-testauksen kliinistä roolia vastasyntyneiden geneettisten sairauksien varalta verrattuna Sanger-sekvensointiin, jotta voimme havaita, voiko tämä uusi tekniikka lyhentää merkittävästi tutkimusaikaa, parantaa diagnoosin määrää, ohjata interventiohoitoja ja edistää ennustetta.

Nämä vastasyntyneet, joilla on diagnosoimaton sairaus, ja osittaiset perheet, voivat osallistua tutkimukseen. Tutkimusväestö rekrytoidaan Fudanin yliopiston lastensairaalan laitospotilasväestöstä, ensisijaisesti vastasyntyneiden tehohoitoyksiköstä (NICU), ja osa väestöstä esitellään muille Kiinan sairaaloille. Kaikki sairastuneen tutkimuksen osallistujat saavat geneettisen seulonnan kliinisen oireensa mukaan. Kaikilta koehenkilöiltä otetaan verinäyte DNA-eristystä ja genomista sekvensointia varten tutkimukseen ilmoittautumisen yhteydessä. Kaikki verinäytteen tilavuudet noudattavat Fudan-menettelyä lapsipotilaiden enimmäisveren osalta. Lisäksi aivo-selkäydinneste- ja kudosnäytteitä voidaan kerätä ja säilyttää bionäytepankissa. DNA eristetään ja valmistetaan NGS:ää tai Sangeria varten Fudan-protokollien avulla Fudanin yliopiston lastensairaalan Translational Medicine Centerissä. Myös osittaisia ​​sukunäytteitä otetaan ja nukleiinihapot sekvensoidaan, kuten on osoitettu, auttamaan vastasyntyneen geneettisen sairauden diagnosoinnissa. Kaikki sekvensointitiedot tallennetaan Genome Centerin bioarkistoon. Jos positiivisia tutkimustuloksia, jotka voivat olla diagnostisia, tutkijamme suorittaa vahvistavan kliinisen diagnostisen testin, ja jos se vahvistetaan, tavallinen kliininen diagnostinen raportti tallennetaan potilaan sairauskertomukseen. Potilaan perheen seurantaa ohjaa kliininen hoitotiimi. Sekä molekyylidiagnoosien tulokset että diagnoosin kesto kirjataan ensisijaiseksi tuloksiksi.

Lisäksi nämä tiedot auttavat lievittämään perheen ahdistusta ja tarjoavat myös mekanismin, jolla potilas siirtyy nopeaan NGS-haaraan, jos potilas on kliinisesti heikentynyt ja kliinisen hoitoryhmän pyynnöstä. Joka kerta kun tutkimukseen osallistuja otetaan mukaan, kliinikkoa ja vanhempia pyydetään täyttämään kysely ennen NGS-testausta ja tulosten palauttamisen jälkeen. Tarkastelemme myös potilaan sairauskertomusta ja keräämme kliinisiä muuttujia, mukaan lukien laboratoriotutkimukset, radiologian tulokset, lääkkeet ja muut saadut hoidot, jotta voimme analysoida tarkemmin NGS:n vaikutusta kliiniseen hoitoon. Joten perimmäinen tavoite on yksilöllinen tai henkilökohtainen terapia. Aiomme seurata perheitä vuosittain enintään 18 kuukautta ilmoittautumisen jälkeen ja kirjata tähän tutkimukseen liittyvät kliiniset tulokset.