Cellefrit cirkulerende nukleinsyrer som ny tumordiagnostik fra humane plasmaprøver.

Cellefrit cirkulerende frie nukleinsyrer er nye substrater til laboratoriediagnostik inden for en række medicinske områder, herunder onkologi, transfusionsmedicin, gynækologi/obstetrik, inflammatoriske og autoimmune sygdomme osv. Der er forskellige kvaliteter af cellefri nukleinsyrer. Inden for onkologi er det blevet vist, at den tidlige påvisning af cellefri nukleinsyrer, der stammer fra tumoren, går forud for den diagnostiske påvisning af klinisk tilbagefald som udført ved billeddannelsesteknikker eller kliniske symptomer med 6-8 måneder.

Exosomer er små lipid-dobbeltlagsmembranvesikler (30-100 nm), der frigives fra alle celletyper ind i det ekstracellulære rum. Disse små membranvesikler transmitterer EV-medierede signaler af proteiner, lipider, nukleinsyrer og sukkerarter, og det unikke molekylære mønster i denne pakke dirigerer typen af ​​ekstracellulært signal, der skal transmitteres til målceller. Interessen for exosomer spænder fra deres virkemåde og forskellige funktioner i kroppen til mere praktiske anvendelser såsom udvikling af biomarkører baseret på analyse af deres RNA- og proteinindhold og deres anvendelse i klinisk diagnostik. Det blev foreslået, at mikro-RNA'er overføres gennem exosomer til modtagerceller og der kan mediere undertrykkelse af deres mRNA-mål.

Brugen af ​​meget dyre målrettede terapier (f.eks. tyrosinkinasehæmmere eller PARP-hæmmere) kan blive forældede under behandlingen på grund af ændringer i den maligne tumors mutationelle molekylære profil. Faktisk, hvis tidlig påvisning af cellefri nukleinsyrer tyder på terapisvigt, kan ny lagdeling af patienten og ændrede terapimodaliteter være mulige i fremtiden, hvilket således bidrager til at forlænge den samlede overlevelse af tumorpatienter.

Forskningens formål:

• At isolere exosomer som en stabil kilde til cellefri nukleinsyrer.
• At udføre proteinprofilering på de isolerede exosomer.
• At isolere nukleinsyrer fra exosomer til analyse.
• At definere og udvikle standarder og protokoller for cellefri nukleinsyreanalyse, især vedrørende epigenetiske ændringer med vægt på DNA-methylering.
• Optimering af præanalytisk proces for at forbedre de præanalytiske aspekter af assays.
• For at teste stabiliteten af ​​methyleret sammenlignet med ikke-methyleret cirkulerende DNA under forskellige præanalytiske forhold.