Cellfri cirkulerande nukleinsyror som ny tumördiagnostik från humana plasmaprover.

Cellfria cirkulerande fria nukleinsyror är nya substrat för laboratoriediagnostik inom ett antal medicinska områden inklusive onkologi, transfusionsmedicin, gynekologi/obstetrik, inflammatoriska och autoimmuna sjukdomar etc. Det finns olika kvaliteter av cellfria nukleinsyror. Inom onkologi har det visat sig att tidig detektering av cellfria nukleinsyror som härrör från tumören föregår den diagnostiska upptäckten av kliniskt återfall som gjorts med bildbehandlingstekniker eller kliniska symtom med 6-8 månader.

Exosomer är små lipid-dubbelskiktsmembranvesiklar (30-100 nm) som frigörs från alla celltyper till det extracellulära utrymmet. Dessa små membranvesiklar överför EV-medierade signaler av proteiner, lipider, nukleinsyror och sockerarter, och det unika molekylära mönstret i detta paket styr typen av extracellulär signal som ska överföras till målceller. Intresset för exosomer sträcker sig från deras verkningssätt och olika funktioner i kroppen till mer praktiska tillämpningar såsom utveckling av biomarkörer baserade på analys av deras RNA- och proteininnehåll och deras användning i klinisk diagnostik. Det föreslogs att mikro-RNA överförs genom exosomer till mottagarceller och där kan förmedla undertryckande av deras mRNA-mål.

Användningen av mycket dyra riktade terapier (t.ex. tyrosinkinashämmare eller PARP-hämmare) kan bli föråldrade under behandlingen på grund av förändringar i den maligna tumörens mutationsmolekylära profil. Faktum är att om tidig upptäckt av cellfria nukleinsyror tyder på terapimisslyckande, kan ny stratifiering av patienten och ändrade terapimodaliteter vara möjliga i framtiden, vilket kan bidra till att förlänga den totala överlevnaden för tumörpatienter.

Forskningens mål:

• Att isolera exosomer som en stabil källa för cellfria nukleinsyror.
• Att utföra proteinprofilering på de isolerade exosomerna.
• Att isolera nukleinsyror från exosomer för analys.
• Att definiera och utveckla standarder och protokoll för analys av cellfria nukleinsyror, särskilt avseende epigenetiska förändringar med tonvikt på DNA-metylering.
• Optimering av preanalytisk process för att förbättra de preanalytiska aspekterna av analyser.
• För att testa stabiliteten hos metylerat jämfört med icke-metylerat cirkulerande DNA under olika preanalytiska förhållanden.