Soluvapaat kiertävät nukleiinihapot uutena kasvaindiagnostiikkana ihmisen plasmanäytteistä.

Soluvapaasti kiertävät vapaat nukleiinihapot ovat uusia substraatteja laboratoriodiagnostiikassa useilla lääketieteen aloilla, mukaan lukien onkologia, verensiirtolääketiede, gynekologia/synnityslääketiede, tulehdus- ja autoimmuunisairaudet jne. Soluvapaita nukleiinihappoja on erilaisia. Onkologiassa on osoitettu, että kasvaimesta peräisin olevien soluvapaiden nukleiinihappojen varhainen havaitseminen edeltää kuvantamistekniikoilla tai kliinisillä oireilla tehtyä kliinisen uusiutumisen diagnostista havaitsemista 6-8 kuukautta.

Eksosomit ovat pieniä, lipidikaksoiskalvorakkuloita (30-100 nm), jotka vapautuvat kaikista solutyypeistä solunulkoiseen tilaan. Nämä pienet kalvovesikkelit välittävät EV-välitteisiä signaaleja proteiinien, lipidien, nukleiinihappojen ja sokereiden kautta, ja tämän paketin ainutlaatuinen molekyylikuvio ohjaa kohdesoluihin välitettävän solunulkoisen signaalin tyyppiä. Kiinnostus eksosomeja kohtaan vaihtelee niiden toimintatavasta ja erilaisista toiminnoista kehossa käytännön sovelluksiin, kuten niiden RNA- ja proteiinipitoisuuden analysointiin perustuvien biomarkkerien kehittämiseen ja niiden käyttöön kliinisessä diagnostiikassa. Ehdotettiin, että mikro-RNA:t siirretään eksosomien kautta vastaanottajasoluihin ja voivat siellä välittää mRNA-kohteidensa repressiota.

Erittäin kalliiden kohdennettujen hoitojen käyttö (esim. tyrosiinikinaasin estäjät tai PARP-estäjät) voivat vanhentua hoidon aikana pahanlaatuisen kasvaimen mutaatiomolekyyliprofiilin muutosten vuoksi. Itse asiassa, jos soluvapaiden nukleiinihappojen varhainen havaitseminen viittaa hoidon epäonnistumiseen, potilaan uusi kerrostuminen ja muuttuneet hoitomenetelmät voivat olla mahdollisia tulevaisuudessa, mikä auttaa pidentämään kasvainpotilaiden kokonaiseloonjäämistä.

Tutkimuksen tavoitteet:

• Eksosomien eristämiseen soluvapaiden nukleiinihappojen vakaana lähteenä.
• Proteiiniprofiloinnin suorittaminen eristetyille eksosomeille.
• Nukleiinihappojen eristäminen eksosomeista analysointia varten.
• Määritellä ja kehittää standardeja ja protokollia soluvapaiden nukleiinihappojen analysointiin erityisesti koskien epigeneettisiä muutoksia painottaen DNA:n metylaatiota.
• Esianalyyttisen prosessin optimointi määritysten esianalyyttisten näkökohtien parantamiseksi.
• Metyloidun DNA:n stabiilisuuden testaamiseksi verrattuna metyloitumattomaan kiertävään DNA:han erilaisissa esianalyyttisissä olosuhteissa.