Cellefri sirkulerende nukleinsyrer som ny tumordiagnostikk fra humane plasmaprøver.

Cellefrie sirkulerende frie nukleinsyrer er nye substrater for laboratoriediagnostikk innen en rekke medisinske områder, inkludert onkologi, transfusjonsmedisin, gynekologi/obstetrikk, inflammatoriske og autoimmune sykdommer etc. Det finnes ulike kvaliteter av cellefrie nukleinsyrer. I onkologi har det vist seg at tidlig påvisning av cellefrie nukleinsyrer som stammer fra svulsten går før den diagnostiske påvisningen av klinisk tilbakefall som gjort ved hjelp av bildeteknikker eller kliniske symptomer med 6-8 måneder.

Eksosomer er små lipid-dobbeltlags membranvesikler (30-100 nm) som frigjøres fra alle celletyper inn i det ekstracellulære rommet. Disse små membranvesiklene overfører EV-medierte signaler av proteiner, lipider, nukleinsyrer og sukker, og det unike molekylære mønsteret til denne pakken styrer typen ekstracellulært signal som skal overføres til målceller. Interessen for eksosomer spenner fra deres virkemåte og ulike funksjoner i kroppen til mer praktiske anvendelser som utvikling av biomarkører basert på analyse av deres RNA- og proteininnhold og deres bruk i klinisk diagnostikk. Det ble foreslått at mikro-RNA-er overføres gjennom eksosomer til mottakerceller og kan der formidle undertrykkelse av deres mRNA-mål.

Bruken av svært kostbare målrettede terapier (f.eks. tyrosinkinasehemmere eller PARP-hemmere) kan bli foreldet under behandlingen på grunn av endringer i den mutasjonsmolekylære profilen til den ondartede svulsten. Faktisk, hvis tidlig påvisning av cellefrie nukleinsyrer tyder på terapisvikt, kan ny lagdeling av pasienten og endrede terapimodaliteter være mulig i fremtiden, og dermed bidra til å forlenge den totale overlevelsen av tumorpasienter.

Mål med forskningen:

• For å isolere eksosomer som en stabil kilde til cellefrie nukleinsyrer.
• For å utføre proteinprofilering på de isolerte eksosomer.
• For å isolere nukleinsyrer fra eksosomer for analyse.
• Å definere og utvikle standarder og protokoller for cellefri nukleinsyreanalyse, spesielt angående epigenetiske endringer med vekt på DNA-metylering.
• Optimalisering av pre-analytisk prosess for å forbedre de pre-analytiske aspektene ved analyser.
• For å teste stabiliteten til metylert sammenlignet med ikke-metylert sirkulerende DNA under forskjellige pre-analytiske forhold.