Husstandstransmissionsdynamik af multidrug-resistente enterobacterales (HOME)

Multi-Drug Resistant Enterobacterales (MDR-E), dvs. Extended-Spectrum Beta-Lactamase-producerende Enterobacterales (ESBL-E) og Carbapenemase-producerende Enterobacterales (CPE) breder sig over hele verden. Selvom det oprindeligt blev betragtet som et sundhedsrelateret problem, vækker rapporter om ESBL-E-transport og infektioner hos personer uden nogen tidligere udsættelse for sundhedspleje bekymringer om deres alarmerende spredning i samfundet. Meget få rapporter undersøgte dynamikken i transmission af MDR-E fra transportører til husstandsmedlemmer. Risikofaktorer for erhvervelse (relateret til belastning, husholdningsvaner, rejser, erhvervsaktiviteter ...) blev dårligt vurderet.

Kvantificering og forståelse af mekanismerne for husstandstransmission er af stor betydning for at udarbejde kontrolstrategier, der er specielt designet til samfundet.

Hovedformålet er at estimere antallet af bekræftede transmissioner af MDR-E fra et indekstilfælde til relaterede husstandsmedlemmer.

Det primære endepunkt er defineret af den sekundære angrebsrate (SAR) for bekræftede transmissioner, dvs. andelen af ​​bekræftede (baseret på genetisk analyse af stammer) erhvervelser af MDR-E i alle husstandsmedlemmer i løbet af undersøgelsesperioden (tre måneder).

Screening af kvalificerede patienter vil afhænge af en automatisk daglig anmodning af alle MDR-E positive prøver, som allerede er implementeret i de deltagende centre.

Oplysninger om undersøgelsen vil blive givet til berettigede patienter, de, der opfylder berettigelseskriterierne og villige til at deltage, vil blive bedt om ikke at modsætte sig.

Syv dage før hospitalsudskrivning vil indekspatienter, der giver samtykke til at deltage, give en fækal prøve, der skal screenes for MDR-E-bæring. Hvis patienten stadig er positiv ved udskrivelsen til MDR-E fækal transport, vil han/hun indgå i kohorten (=indekstilfælde). Hans/hendes husstandsmedlemmer (=HH-medlemmer) vil derefter blive inviteret til at deltage og inkluderet efter aftale.

Efter inklusion vil indekstilfælde og husstandsmedlemmer blive fulgt op i 3 måneder (+/-7 dage) og bedt om at levere selvindsamlede afføringsprøver og spørgeskemaer på dag7, dag15, dag21, dag30, måned2 og måned3.

Selvindsamlede afføringsprøver vil blive sendt til referencemikrobiologilaboratoriet (Bichat) med selvudfyldte spørgeskemaer.

Derudover, i forbindelse med den supplerende undersøgelse:

For at opnå nøjagtige data om interaktioner mellem husstandsmedlemmer vil der blive brugt Ultra Wide Band (UWB) systemer. I løbet af 4 dage vil indekskasser og husstandsmedlemmer bære en lille trådløs sensor, der kontinuerligt registrerer identiteten af ​​andre sensorer, der er i nærheden. For hver husstand vil der blive optaget på 2 hverdage og 2 weekenddage (lørdag og søndag).

Andel af transmissioner i alle husstandsmedlemmer over undersøgelsesperioden (SAR) og 95 % konfidensintervaller vil blive beregnet ved afslutningen af ​​opfølgningen for både sandsynlige og bekræftede transmissioner og beskrevet i henhold til husstandsstørrelse og indeks-tilfælde befolkningstype. Kaplan Meier overlevelsesanalyse vil blive brugt til at estimere mediantiden til (første) erhvervelse blandt husstandsmedlemmer og en Cox delt skrøbelighedsmodel til at studere variabler forbundet med erhvervelsesindeks-tilfælde og husstandsmedlemmers potentielle eksponeringer, husstandens karakteristika, MDR-E-overflod i indeks-case-patienter, tarmmikrobiota-diversitet og sammensætning). Derudover vil der udvikles en stokastisk individuel baseret model til at fange de multifaktorielle processer involveret i MDR-E transmission. Flere modeller med stigende kompleksitet vil blive bygget for at sammenligne deres sandsynlighed givet de erhvervelser, der er observeret over tid i de forskellige husstande. Modellen vil blive integreret i en slutningsramme for at analysere dataene og estimere modelparametre (f.eks. transmissionshastigheder for de forskellige ruter). Inferensteknikkerne vil involvere bayesiansk statistik, sandsynligvis Markov Chain Monte Carlo med dataforøgelse. De forskellige modeller vil blive sammenlignet ud fra specifikke kriterier, såsom Deviance Information Criterion (DIC). Den parametriserede model valgt i det foregående trin vil blive brugt til at simulere og vurdere forskellige strategier for kontrol af MDR-E-fremkomst og transmission til husholdninger.