Dinâmica de transmissão doméstica de enterobactérias multirresistentes (HOME)

Enterobacterales resistentes a múltiplas drogas (MDR-E), ou seja, As enterobactérias produtoras de beta-lactamase de espectro estendido (ESBL-E) e as enterobactérias produtoras de carbapenemases (CPE) estão se espalhando em todo o mundo. Embora inicialmente considerado um problema relacionado à saúde, relatos de portadores de ESBL-E e infecções em indivíduos sem qualquer exposição prévia aos cuidados de saúde levantam preocupações sobre sua disseminação alarmante na comunidade. Muito poucos relatórios investigaram a dinâmica da transmissão de MDR-E de portadores para membros da família. Os fatores de risco de aquisição (relacionados ao esforço, hábitos domésticos, viagens, atividades ocupacionais…) foram mal avaliados.

Quantificar e compreender os mecanismos de transmissão domiciliar é de suma importância para a elaboração de estratégias de controle voltadas especificamente para a comunidade.

O objetivo principal é estimar a taxa de transmissões confirmadas de MDR-E de um caso índice para membros familiares relacionados.

O endpoint primário é definido pela taxa de ataque secundário (SAR) para transmissões confirmadas, ou seja, a proporção de aquisições confirmadas (com base na análise genética de cepas) de MDR-E em todos os membros da família durante o período do estudo (três meses).

A triagem de pacientes elegíveis dependerá de uma solicitação diária automatizada de todas as amostras positivas MDR-E já implementadas nos centros participantes.

Informações sobre o estudo serão fornecidas aos pacientes elegíveis, aqueles que atenderem aos critérios de elegibilidade e desejarem participar serão solicitados a não se opor.

Sete dias antes da alta hospitalar, os pacientes índices que consentirem em participar fornecerão uma amostra fecal para ser rastreada quanto à presença de MDR-E. Se o paciente ainda for positivo na alta para portador fecal MDR-E, ele/ela será incluído na coorte (= caso índice). Os membros de sua família (= membros do HH) serão então convidados a participar e incluídos após acordo.

Após a inclusão, os casos índices e os membros da família serão acompanhados prospectivamente por 3 meses (+/- 7 dias) e solicitados a fornecer amostras de fezes coletadas e questionários no dia 7, dia 15, dia 21, dia 30, mês2 e mês3.

Amostras de fezes auto coletadas serão enviadas ao laboratório de microbiologia de referência (Bichat) com questionários autopreenchidos.

Além disso, no contexto do estudo auxiliar:

Para obter dados precisos sobre as interações entre os membros da família, serão usados ​​sistemas de banda ultralarga (UWB). Durante 4 dias, casos de índice e membros da família usarão um pequeno sensor sem fio que registra continuamente a identidade de outros sensores próximos. Para cada domicílio, a gravação será realizada em 2 dias da semana e 2 dias de fim de semana (sábado e domingo).

A proporção de transmissões em todos os membros da família durante o período do estudo (SAR) e os intervalos de confiança de 95% serão calculados no final do acompanhamento para transmissões prováveis ​​e confirmadas e descritos de acordo com o tamanho da família e o tipo de população de caso-índice. A análise de sobrevivência de Kaplan Meier será usada para estimar o tempo médio para a (primeira) aquisição entre os membros da família e um modelo de fragilidade compartilhada de Cox para estudar variáveis ​​associadas ao caso-índice de aquisição e exposições potenciais dos membros da família, características da família, abundância de MDR-E em pacientes-caso índice, diversidade e composição da microbiota intestinal). Além disso, será desenvolvido um modelo estocástico individual para capturar os processos multifatoriais envolvidos na transmissão MDR-E. Vários modelos de complexidade crescente serão construídos de forma a comparar a sua verossimilhança face às aquisições observadas ao longo do tempo nos diferentes agregados familiares. O modelo será integrado em uma estrutura de inferência para analisar os dados e estimar os parâmetros do modelo (por exemplo, taxas de transmissão para as diferentes rotas). As técnicas de inferência envolverão estatísticas bayesianas, provavelmente Markov Chain Monte Carlo com aumento de dados. Os diferentes modelos serão comparados com base em critérios específicos, como o Deviance Information Criterion (DIC). O modelo parametrizado selecionado na etapa anterior será utilizado para simular e avaliar diferentes estratégias de controle do surgimento e transmissão de MDR-E aos domicílios.