Динамика бытовой передачи энтеробактерий с множественной лекарственной устойчивостью (HOME)

Энтеробактерии с множественной лекарственной устойчивостью (MDR-E), т.е. Enterobacterales, продуцирующие бета-лактамазы расширенного спектра действия (ESBL-E), и энтеробактерии, продуцирующие карбапенемазы (CPE), распространяются по всему миру. Хотя изначально это считалось проблемой, связанной со здравоохранением, сообщения о носительстве ESBL-E и инфекциях у людей, ранее не обращавшихся за медицинской помощью, вызывают обеспокоенность по поводу их тревожного распространения в обществе. В очень немногих отчетах исследовалась динамика передачи МЛУ-Э от носителей членам домохозяйств. Факторы риска заражения (связанные с напряжением, бытовыми привычками, поездками, профессиональной деятельностью…) оценивались плохо.

Количественная оценка и понимание механизмов передачи в домашних условиях имеет большое значение для разработки стратегий контроля, специально предназначенных для сообщества.

Основная цель состоит в том, чтобы оценить уровень подтвержденной передачи МЛУ-Э от индексного случая родственным членам домохозяйства.

Первичная конечная точка определяется вторичной частотой поражений (SAR) для подтвержденных случаев передачи, т. е. долей подтвержденных (на основе генетического анализа штаммов) случаев заражения МЛУ-Э у всех членов домохозяйства за период исследования (три месяца).

Скрининг подходящих пациентов будет основываться на автоматическом ежедневном запросе всех положительных образцов MDR-E, который уже реализован в участвующих центрах.

Информация об исследовании будет предоставлена ​​подходящим пациентам, тем, кто соответствует критериям приемлемости и желает участвовать, будет предложено не возражать.

За семь дней до выписки из больницы индексные пациенты, которые согласны участвовать, сдадут образец кала для скрининга на носительство МЛУ-Э. Если при выписке пациент по-прежнему имеет положительный результат на фекальное носительство МЛУ-Э, он/она будет включен в когорту (=указательный случай). Члены его/ее домохозяйства (=члены ДХ) затем будут приглашены к участию и включены после согласования.

После включения индексные случаи и члены домохозяйства будут наблюдаться проспективно в течение 3 месяцев (+/-7 дней), и им будет предложено предоставить образцы стула, собранные самостоятельно, и анкеты на 7-й, 15-й, 21-й, 30-й, 2-й и 3-й день.

Самостоятельно собранные образцы стула будут отправлены по почте в справочную микробиологическую лабораторию (Bichat) вместе с заполненными анкетами.

Кроме того, в контексте дополнительного исследования:

Для получения точных данных о взаимодействии между членами домохозяйства будут использоваться сверхширокополосные (UWB) системы. В течение 4 дней индексаторы и члены домохозяйства будут носить небольшой беспроводной датчик, который постоянно регистрирует идентификатор других датчиков, находящихся в непосредственной близости. Для каждого домохозяйства запись будет производиться в 2 рабочих дня и 2 выходных дня (суббота и воскресенье).

Доля передачи среди всех членов домохозяйства за период исследования (SAR) и 95% доверительные интервалы будут рассчитаны в конце последующего наблюдения как для вероятной, так и для подтвержденной передачи и описаны в соответствии с размером домохозяйства и типом населения с индексным случаем. Анализ выживаемости Каплана Мейера будет использоваться для оценки среднего времени до (первого) заражения среди членов домохозяйства, а общая модель слабости Кокса будет использоваться для изучения переменных, связанных с индексным случаем заражения и потенциальным воздействием членов домохозяйства, характеристиками домохозяйства, распространенностью МЛУ-Э. в индексном случае-пациенты, разнообразие и состав кишечной микробиоты). Кроме того, будет разработана стохастическая индивидуальная модель для учета многофакторных процессов, связанных с передачей MDR-E. Будет построено несколько моделей возрастающей сложности, чтобы сравнить их вероятность с учетом приобретений, наблюдаемых с течением времени в разных домохозяйствах. Модель будет интегрирована в структуру логического вывода для анализа данных и оценки параметров модели (например, скоростей передачи для различных маршрутов). Методы вывода будут включать байесовскую статистику, вероятно, цепь Маркова Монте-Карло с увеличением данных. Различные модели будут сравниваться на основе определенного критерия, такого как информационный критерий отклонения (DIC). Параметризованная модель, выбранная на предыдущем этапе, будет использоваться для моделирования и оценки различных стратегий борьбы с возникновением и передачей МЛУ-Э домохозяйствам.