Mikrobielle Vielfalt im Dünndarm-Stoma-Ausfluss und im Dickdarm-Kot
Darmmikrobielle Vielfalt des Dünndarm-Stoma-Ausflusses und des Dickdarm-Kots von Kindern mit Kurzdarmsyndrom
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Voraussichtlich)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: Wei Cai, MD, PhD
- E-Mail: caiw204@sjtu.edu.cn
Studienorte
-
-
-
Shanghai, China
- Rekrutierung
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
-
Kontakt:
- Wei Cai, MD, PhD
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Patienten mit Darmversagen. Die Patienten zeigten eine gute Verträglichkeit gegenüber der parenteralen und enteralen Ernährungsverabreichung. Der Anteil der enteralen Ernährung liegt bei über 80 %.
Die Stuhlausscheidung wird bei weniger als 50 ml/kg/Tag gehalten. Mindestens eine Woche lang traten keine Komplikationen auf.
Ausschlusskriterien:
- Patienten sind überwiegend auf eine parenterale Ernährung angewiesen. Symptome wie Fieber, Blähungen und Durchfall. Komplikationen wie parenterale ernährungsbedingte Lebererkrankungen, Lungenentzündung und katheterbedingte Infektionen.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
|---|
|
Darm-Stoma-Ausgabe
Keine Eingriffe.
|
|
Dickdarmkot
Keine Eingriffe.
|
|
Gesunde Kontrolle
Keine Eingriffe.
|
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Diversität und Zusammensetzung der Mikrobiota durch 16s-rRNA-Sequenzierung aufgeklärt
Zeitfenster: 1) Probenentnahme: einen Tag vor der Entlassung des Patienten aus dem Krankenhaus; 2)DNA-Extraktion: innerhalb einer Woche nach Probenentnahme; 3)Sequenzierung und Datenanalyse: innerhalb eines Monats nach der DNA-Extraktion
|
DNA der Darmmikrobiota wird extrahiert.
Anschließend werden gereinigte DNA-Amplifikate äquimolar gepoolt und auf einer Illumina MiSeq-Plattform paarweise sequenziert (2 × 250).
Rohe Fastq-Dateien werden mit QIIME (Version 1.17) demultiplext und qualitätsgefiltert.
Als nächstes werden operative taxonomische Einheiten (OTUs) mit einem Ähnlichkeitsgrenzwert von 97 % unter Verwendung von UPARSE Version 7.1 (http://drive5.com/) geclustert.
uparse/) und chimäre Sequenzen werden mithilfe von UCHIME (http://drive5.com/index.htm) identifiziert und entfernt.
Die phylogenetische Zugehörigkeit jeder 16S-rRNA-Gensequenz wird mit RDP Classifier (http://rdp.cme.msu.edu/) analysiert.
gegen die Silva (SSU117/119)16S rRNA.
Der Sobs-Index und der Chao-Index werden zur Bewertung der Mikrobiota-Diversität verwendet.
Die Zusammensetzung der Mikrobiota wird auf verschiedenen Ebenen identifiziert, einschließlich Stamm, Familie und Gattung.
|
1) Probenentnahme: einen Tag vor der Entlassung des Patienten aus dem Krankenhaus; 2)DNA-Extraktion: innerhalb einer Woche nach Probenentnahme; 3)Sequenzierung und Datenanalyse: innerhalb eines Monats nach der DNA-Extraktion
|
Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Mitarbeiter
Mitarbeiter
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Voraussichtlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Voraussichtlich)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- ShanghaiXinhua
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .