Diversità microbica dell'effluente dello stoma dell'intestino tenue e delle feci del colon
Diversità microbica intestinale dell'effluente dello stoma dell'intestino tenue e delle feci del colon di bambini con sindrome dell'intestino corto
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Anticipato)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Contatto studio
Contatto studio
- Nome: Wei Cai, MD, PhD
- Email: caiw204@sjtu.edu.cn
Luoghi di studio
-
-
-
Shanghai, Cina
- Reclutamento
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
-
Contatto:
- Wei Cai, MD, PhD
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Sessi ammissibili allo studio
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Pazienti con insufficienza intestinale. I pazienti hanno mostrato una buona tolleranza alla somministrazione di nutrizione parenterale ed enterale. La percentuale di nutrizione enterale è superiore all'80%.
Produzione di feci mantenuta a meno di 50 ml/kg/giorno. Non si sono verificate complicazioni per almeno 1 settimana.
Criteri di esclusione:
- I pazienti dipendono principalmente dalla nutrizione parenterale. Sintomi come febbre, distensione addominale e diarrea. Complicazioni come malattia epatica associata alla nutrizione parenterale, polmonite e infezione correlata al catetere.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
|---|
|
Uscita stomia intestinale
Nessun intervento.
|
|
Facce del colon
Nessun intervento.
|
|
Controllo sano
Nessun intervento.
|
Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
|
Diversità e composizione del microbiota chiarite dal sequenziamento dell'rRNA 16s
Lasso di tempo: 1) Raccolta dei campioni: un giorno prima della dimissione dei pazienti dall'ospedale; 2)Estrazione del DNA: entro una settimana dal prelievo dei campioni; 3) Sequenziamento e analisi dei dati: entro un mese dall'estrazione del DNA
|
Verrà estratto il DNA del microbiota intestinale.
Quindi gli ampliconi di DNA purificati vengono raggruppati in equimolare e sequenziati all'estremità accoppiata (2 × 250) su una piattaforma Illumina MiSeq.
I file Raw Fastq verranno de-multiplexati, filtrati per la qualità utilizzando QIIME (versione 1.17).
Le unità tassonomiche operative (OTU) verranno successivamente raggruppate con un limite di somiglianza del 97% utilizzando UPARSE versione 7.1 (http://drive5.com/
uparse/) e le sequenze chimeriche saranno identificate e rimosse utilizzando UCHIME (http://drive5.com/index.htm).
L'affiliazione filogenetica di ciascuna sequenza del gene 16S rRNA viene analizzata mediante RDP Classifier (http://rdp.cme.msu.edu/)
contro l'rRNA silva (SSU117/119)16S.
L'indice di Sobs e l'indice di Chao saranno utilizzati per valutare la diversità del microbiota.
La composizione del microbiota sarà identificata su diversi livelli tra cui phylum, famiglia e genere.
|
1) Raccolta dei campioni: un giorno prima della dimissione dei pazienti dall'ospedale; 2)Estrazione del DNA: entro una settimana dal prelievo dei campioni; 3) Sequenziamento e analisi dei dati: entro un mese dall'estrazione del DNA
|
Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Collaboratori
Collaboratori
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
Studiare le date dei record
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
Inizio studio
Completamento primario (Anticipato)
Completamento primario
Completamento dello studio (Anticipato)
Completamento dello studio
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Primo Inserito
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- ShanghaiXinhua
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .