Mikrobiel mangfoldighed af tyndtarmsstomiafløb og tyktarmsfæces
Intestinal mikrobiel mangfoldighed af tyndtarmsstomiafløb og colonafføring fra børn med korttarmssyndrom
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Wei Cai, MD, PhD
- E-mail: caiw204@sjtu.edu.cn
Studiesteder
-
-
-
Shanghai, Kina
- Rekruttering
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
-
Kontakt:
- Wei Cai, MD, PhD
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Patienter med tarmsvigt. Patienterne viste god tolerance over for parenteral og enteral ernæringsadministration. Andelen af enteral ernæring er mere end 80%.
Afføringsoutput holdes på mindre end 50 ml/kg/dag. Der opstod ingen komplikationer i mindst 1 uge.
Ekskluderingskriterier:
- Patienter er hovedsageligt afhængige af parenteral ernæring. Symptomer som feber, udspilet mave og diarré. Komplikationer som parenteral ernæringsassocieret leversygdom, lungebetændelse og kateterrelateret infektion.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
|---|
|
Intestinal stomi output
Ingen indgreb.
|
|
Colon afføring
Ingen indgreb.
|
|
Sund kontrol
Ingen indgreb.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Mikrobiota-diversitet og sammensætning afklaret ved 16s rRNA-sekventering
Tidsramme: 1) Prøveindsamling: en dag før patienter udskrives fra hospitalet; 2) DNA-ekstraktion: inden for en uge efter prøveindsamling; 3) Sekvensering og dataanalyse: inden for en måned efter DNA-ekstrakt
|
DNA fra tarmmikrobiota vil blive ekstraheret.
Derefter samles oprensede DNA-amplikoner i ækvimolære og parrede ende sekventeres (2 × 250) på en Illumina MiSeq-platform.
Rå Fastq-filer vil blive de-multiplekset, kvalitetsfiltreret ved hjælp af QIIME (version 1.17).
Operationelle taksonomiske enheder (OTU'er) vil næste gang blive grupperet med 97 % lighedsgrænse ved hjælp af UPARSE version 7.1 (http://drive5.com/
uparse/) og kimære sekvenser vil blive identificeret og fjernet ved hjælp af UCHIME (http://drive5.com/index.htm).
Den fylogenetiske tilknytning af hver 16S rRNA gensekvens analyseres af RDP Classifier (http://rdp.cme.msu.edu/)
mod silva (SSU117/119)16S rRNA.
Sobs-indeks og Chao-indeks vil blive brugt til at evaluere mikrobiota-diversiteten.
Mikrobiotasammensætning vil blive identificeret på forskellige niveauer, herunder phylum, familie og slægt.
|
1) Prøveindsamling: en dag før patienter udskrives fra hospitalet; 2) DNA-ekstraktion: inden for en uge efter prøveindsamling; 3) Sekvensering og dataanalyse: inden for en måned efter DNA-ekstrakt
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Forventet)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Forventet)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- ShanghaiXinhua
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .