Diversidade microbiana do efluente do estoma do intestino delgado e fezes colônicas
Diversidade microbiana intestinal do efluente do estoma do intestino delgado e fezes colônicas de crianças com síndrome do intestino curto
Visão geral do estudo
Status
Status
Condições
Condições
Tipo de estudo
Tipo de estudo
Inscrição (Antecipado)
Inscrição
Contactos e Locais
Contato de estudo
Contato de estudo
- Nome: Wei Cai, MD, PhD
- E-mail: caiw204@sjtu.edu.cn
Locais de estudo
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Shanghai, China
- Recrutamento
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
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Contato:
- Wei Cai, MD, PhD
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
Aceita Voluntários Saudáveis
Gêneros Elegíveis para o Estudo
Método de amostragem
População do estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- Pacientes com insuficiência intestinal. Os pacientes apresentaram boa tolerância à administração de nutrição parenteral e enteral. A proporção de nutrição enteral é superior a 80%.
Débito fecal mantido abaixo de 50mL/kg/dia. Nenhuma complicação ocorreu por pelo menos 1 semana.
Critério de exclusão:
- Os pacientes dependem principalmente de nutrição parenteral. Sintomas como febre, distensão abdominal e diarreia. Complicações como doença hepática associada à nutrição parenteral, pneumonia e infecção relacionada ao cateter.
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Número de grupos/coortes
Coortes e Intervenções
Grupo / CoorteGrupo / Coorte |
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Saída do estoma intestinal
Sem intervenções.
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Fezes colônicas
Sem intervenções.
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Controle Saudável
Sem intervenções.
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Diversidade e composição da microbiota esclarecidas por sequenciamento de 16s rRNA
Prazo: 1)Coleta de amostras: um dia antes da alta do paciente; 2) Extração de DNA: até uma semana após a coleta das amostras; 3) Sequenciamento e análise de dados: dentro de um mês após a extração do DNA
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O DNA da microbiota intestinal será extraído.
Em seguida, os amplicons de DNA purificados são agrupados em sequências equimolares e pareadas (2 × 250) em uma plataforma Illumina MiSeq.
Os arquivos Raw Fastq serão desmultiplexados e filtrados com qualidade usando o QIIME (versão 1.17).
Unidades taxonômicas operacionais (OTUs) serão agrupadas em seguida com corte de similaridade de 97% usando UPARSE versão 7.1 (http://drive5.com/
uparse/) e sequências quiméricas serão identificadas e removidas usando UCHIME (http://drive5.com/index.htm).
A afiliação filogenética de cada sequência do gene 16S rRNA é analisada pelo RDP Classifier (http://rdp.cme.msu.edu/)
contra o silva (SSU117/119)16S rRNA.
Os índices de Sobs e Chao serão utilizados para avaliar a diversidade da microbiota.
A composição da microbiota será identificada em diferentes níveis, incluindo filo, família e gênero.
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1)Coleta de amostras: um dia antes da alta do paciente; 2) Extração de DNA: até uma semana após a coleta das amostras; 3) Sequenciamento e análise de dados: dentro de um mês após a extração do DNA
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Colaboradores e Investigadores
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Colaboradores
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Publicações e links úteis
Publicações Gerais
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Início do estudo
Conclusão Primária (Antecipado)
Conclusão Primária
Conclusão do estudo (Antecipado)
Conclusão do estudo
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Primeira postagem
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última Atualização Postada
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
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Última verificação
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Termos relacionados a este estudo
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- ShanghaiXinhua
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Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
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