Różnorodność mikrobiologiczna ścieków ze stomii jelita cienkiego i kału okrężnicy
Różnorodność drobnoustrojów jelitowych w wydzielinie ze stomii jelita cienkiego i kale okrężnicy u dzieci z zespołem krótkiego jelita
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Oczekiwany)
Zapisy
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Wei Cai, MD, PhD
- E-mail: caiw204@sjtu.edu.cn
Lokalizacje studiów
-
-
-
Shanghai, Chiny
- Rekrutacyjny
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
-
Kontakt:
- Wei Cai, MD, PhD
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjenci z niewydolnością jelit. Pacjenci wykazywali dobrą tolerancję na żywienie pozajelitowe i dojelitowe. Udział żywienia dojelitowego przekracza 80%.
Wydalanie stolca utrzymywane na poziomie poniżej 50 ml/kg/dzień. Przez co najmniej 1 tydzień nie wystąpiły żadne powikłania.
Kryteria wyłączenia:
- Pacjenci są zdani głównie na żywienie pozajelitowe. Objawy takie jak gorączka, wzdęcia brzucha i biegunka. Powikłania, takie jak choroba wątroby związana z żywieniem pozajelitowym, zapalenie płuc i infekcja związana z cewnikiem.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
|---|
|
Wyjście ze stomii jelitowej
Brak interwencji.
|
|
Kał okrężnicy
Brak interwencji.
|
|
Zdrowa kontrola
Brak interwencji.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Różnorodność i skład mikrobiomu wyjaśnione przez sekwencjonowanie 16s rRNA
Ramy czasowe: 1) Pobieranie próbek: jeden dzień przed wypisem pacjentów ze szpitala; 2) Ekstrakcja DNA: w ciągu jednego tygodnia po pobraniu próbek; 3) Sekwencjonowanie i analiza danych: w ciągu jednego miesiąca po ekstrakcji DNA
|
DNA mikroflory jelitowej zostanie wyekstrahowane.
Następnie oczyszczone amplikony DNA łączy się w równomolowe i sekwencjonuje sparowane końce (2 x 250) na platformie Illumina MiSeq.
Surowe pliki Fastq zostaną poddane demultipleksowaniu i filtrowaniu jakości przy użyciu QIIME (wersja 1.17).
Operacyjne jednostki taksonomiczne (OTU) będą następnie grupowane z 97% odcięciem podobieństwa przy użyciu UPARSE w wersji 7.1 (http://drive5.com/
uparse/), a sekwencje chimeryczne zostaną zidentyfikowane i usunięte przy użyciu UCHIME (http://drive5.com/index.htm).
Przynależność filogenetyczna każdej sekwencji genu 16S rRNA jest analizowana przez RDP Classifier (http://rdp.cme.msu.edu/)
przeciwko silva (SSU117/119)16S rRNA.
Do oceny różnorodności mikrobiomu zostaną wykorzystane indeksy Sobs i Chao.
Skład mikrobiomu zostanie zidentyfikowany na różnych poziomach, w tym typu, rodziny i rodzaju.
|
1) Pobieranie próbek: jeden dzień przed wypisem pacjentów ze szpitala; 2) Ekstrakcja DNA: w ciągu jednego tygodnia po pobraniu próbek; 3) Sekwencjonowanie i analiza danych: w ciągu jednego miesiąca po ekstrakcji DNA
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Współpracownicy
Współpracownicy
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Oczekiwany)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- ShanghaiXinhua
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .