Multi-Omics-Analysen zur Ätiologie und Früherkennung von Magenkrebs-Vorläuferläsionen

Die Studienpopulation ist Teil des schwedischen Zwillingsregisters (STR), das seit seiner Gründung Ende der 1950er Jahre Fragebogendaten aller nach 1886 geborenen Zwillinge sammelt. Die Daten in dieser spezifischen Studie sind eine Teilmenge der Screening Across the Lifespan (SALT)-Studie innerhalb des STR, in der alle zwischen 1911 und 1958 geborenen Zwillinge zwischen 1998 und 2002 befragt wurden. Die Teilkohorte namens TwinGene wurde zwischen 2004 und 2008 gegründet, als die Teilnehmer aufgefordert wurden, einen Fragebogen zu häufigen Krankheiten zu beantworten und eine Blutprobe abzugeben. Von 12.618 Zwillingen, die 1958 oder früher geboren wurden, wurden Proben entnommen, von denen Blutproben von 12.609 zur Verfügung standen. Nach Ausschluss von 10 Proben, die keinen Bezug zu den verfügbaren Umweltdaten herstellen konnten, wurden insgesamt 12.599 Blutproben analysiert. Das korpusdominante CAG zeichnete sich durch ein PGI/PGII-Verhältnis von weniger als 3 aus. Das Metabolomprofil anhand von Serumproben wurde auf Basis der Nightingale Blood Biomarker Analysis-Plattform durchgeführt. Die proteomische Profilierung wird sowohl vom Scanning SWATH als auch vom OLINK® Explore 384 Oncology Panel durchgeführt. Die Vorgeschichte einer H. pylori-Infektion wird durch die Messung von Serum-IgG-Antikörpern gegen H. pylori mittels ELISA untersucht. Detaillierte Informationen zum Lebensstil, die durch Fragebögen gesammelt werden, umfassen Bildung, Rauchen, Schnupftabak, Alkoholkonsum, Drogenkonsum, Ernährung sowie Größe/Gewicht usw. Metaboliten werden aufgrund ihrer normalerweise verzerrten Verteilung vor der Analyse logarithmisch transformiert. Für jeden Metaboliten werden zunächst CAG-Patienten mit allen CAG-freien Kontrollen verglichen. Der Wilcoxon-Mann-Whitney-Test oder der Kruskal-Wallis-Test werden zum Vergleich der Unterschiede in der Proteinexpression zwischen CAG- und Nicht-CAG-Gruppen verwendet, und mehrere Vergleiche werden mithilfe der Bonferroni-Korrektur angepasst. Modelle mit verallgemeinerter Schätzungsgleichung (GEE) mit der robusten Option werden angepasst, um die Odds Ratios (ORs) zu schätzen. Zweitens werden im Vergleich mit MZ-Zwillingskontrollen und DZ-Zwillingskontrollen nur vollständige Zwillingspaare mit nicht übereinstimmendem CAG in die Studie einbezogen. Insbesondere werden bedingte logistische Regressionsmodelle verwendet, um die Übereinstimmung innerhalb von Zwillingspaaren zu kontrollieren. Wir werden Metabolomik- und Proteomikdaten weiter kombinieren und versuchen, ein CAG-Vorhersagemodell aufzubauen. Zu den Kovariaten gehören Alter, Geschlecht, H. pylori-Seropositivität, Bildungsniveau, Rauchen, Schnupftabak-Eintauchen und Alkoholkonsum. Auch gemeinsame Effekte verschiedener Metaboliten und die Interaktion mit anderen Kovariaten werden untersucht.