Analisi multi-omiche sull'eziologia e sulla diagnosi precoce delle lesioni precursori del cancro allo stomaco

La popolazione oggetto dello studio fa parte del Registro svedese dei gemelli (STR), che sin dalla sua istituzione alla fine degli anni '50 ha raccolto i dati dei questionari di tutti i gemelli nati dopo il 1886. I dati di questo studio specifico sono un sottoinsieme dello studio Screening Across the Lifespan (SALT) all'interno dello STR, in cui tutti i gemelli nati tra il 1911 e il 1958 sono stati intervistati tra il 1998 e il 2002. La sottocoorte denominata TwinGene è stata creata tra gli anni 2004 e 2008 quando i partecipanti sono stati invitati a rispondere a un questionario sulle malattie comuni e a fornire un campione di sangue. Sono stati raccolti campioni da 12.618 gemelli nati nel 1958 o prima, di cui erano disponibili campioni di sangue di 12.609. Dopo aver escluso 10 campioni che non erano in grado di collegarsi ai dati ambientali disponibili, sono stati analizzati un totale di 12.599 campioni di sangue. Il CAG corpo-dominante era caratterizzato da un rapporto PGI/PGII inferiore a 3. Il profilo metabolomico utilizzando campioni di siero è stato eseguito sulla base della piattaforma di analisi dei biomarcatori del sangue di Nightingale. La profilazione proteomica verrà eseguita sia dal pannello Scanning SWATH che da OLINK® Explore 384 Oncology. La storia dell'infezione da H. pylori viene esaminata misurando gli anticorpi IgG sierici contro H. pylori, utilizzando l'ELISA. Le informazioni dettagliate sullo stile di vita raccolte dai questionari includono istruzione, fumo, consumo di tabacco da fiuto, consumo di alcol, uso di droghe, dieta e altezza/peso, ecc. I metaboliti verranno trasformati in log prima delle analisi, a causa della loro distribuzione solitamente distorta. Per ciascun metabolita, in primo luogo, i pazienti CAG verranno confrontati con tutti i controlli CAG-free. Il test di Wilcoxon-Mann-Whitney o il test di Kruskal-Wallis verranno utilizzati per confrontare le differenze di espressione proteica tra gruppi CAG e non-CAG e i confronti multipli verranno aggiustati utilizzando la correzione di Bonferroni. I modelli di equazioni di stima generalizzata (GEE) con l'opzione robusta verranno adattati per stimare gli odds ratio (OR). In secondo luogo, nel confronto con co-gemelli di controllo MZ e co-gemelli di controllo DZ, nello studio verranno incluse solo coppie di gemelli completi con CAG discordante. Nello specifico, verranno utilizzati modelli di regressione logistica condizionale per controllare l'abbinamento all'interno di coppie di co-gemelli. Combineremo ulteriormente i dati di metabolomica e proteomica e proveremo a costruire un modello di previsione CAG. Le covariate includeranno età, sesso, sieropositività per H. pylori, livello di istruzione, fumo, consumo di tabacco da fiuto e consumo di alcol. Verranno inoltre esaminati gli effetti congiunti di diversi metaboliti e l'interazione con altre covariate.