Analizy wieloomiczne dotyczące etiologii i wczesnego wykrywania zmian poprzedzających raka żołądka

Badana populacja stanowi część Szwedzkiego Rejestru Bliźniąt (STR), który od chwili jego utworzenia pod koniec lat pięćdziesiątych XX wieku gromadzi dane kwestionariuszowe dotyczące wszystkich bliźniąt urodzonych po 1886 roku. Dane zawarte w tym konkretnym badaniu stanowią podzbiór badania Screening Across the Lifespan (SALT) przeprowadzonego w STR, w ramach którego przeprowadzono wywiady ze wszystkimi bliźniakami urodzonymi w latach 1911–1958 w latach 1998–2002. Podkohortę o nazwie TwinGene utworzono w latach 2004–2008, kiedy uczestników poproszono o wypełnienie kwestionariusza dotyczącego powszechnych chorób i dostarczenie próbki krwi. Pobrano próbki od 12 618 bliźniąt urodzonych w 1958 r. lub wcześniej, z czego dostępna była krew od 12 609. Po wykluczeniu 10 próbek, których nie udało się powiązać z dostępnymi danymi środowiskowymi, przeanalizowano łącznie 12 599 próbek krwi. CAG z dominacją ciałka charakteryzował się stosunkiem PGI/PGII mniejszym niż 3. Profilowanie metabolomiczne przy użyciu próbek surowicy przeprowadzono w oparciu o platformę analizy biomarkerów krwi Nightingale. Profilowanie proteomiczne zostanie wykonane zarówno przez panel Scanning SWATH, jak i OLINK® Explore 384 Oncology. Historię zakażenia H. pylori bada się poprzez pomiar przeciwciał IgG w surowicy przeciwko H. pylori za pomocą testu ELISA. Szczegółowe informacje dotyczące stylu życia zebrane za pomocą kwestionariuszy obejmują wykształcenie, palenie tytoniu, zażywanie tabaki, picie alkoholu, zażywanie narkotyków, dietę oraz wzrost/wagę itp. Metabolity zostaną poddane transformacji logarytmicznej przed analizami ze względu na ich zwykle nierówny rozkład. W przypadku każdego metabolitu, po pierwsze, pacjenci z CAG zostaną porównani ze wszystkimi kontrolami wolnymi od CAG. Do porównania różnic w ekspresji białek pomiędzy grupami CAG i grupami nie-CAG zostanie zastosowany test Wilcoxona-Manna-Whitneya lub test Kruskala-Wallisa, a wielokrotne porównania zostaną skorygowane przy użyciu poprawki Bonferroniego. W celu oszacowania ilorazów szans (OR) zostaną dopasowane modele uogólnionego równania estymacji (GEE) z opcją solidną. Po drugie, w porównaniu z grupą kontrolną bliźniąt MZ i grupą kontrolną bliźniaków DZ, do badania zostaną włączone tylko kompletne pary bliźniąt z niezgodnym CAG. W szczególności modele warunkowej regresji logistycznej zostaną wykorzystane do kontroli dopasowania w parach bliźniaków. Będziemy dalej łączyć dane metabolomiczne i proteomiczne i próbować zbudować model predykcyjny CAG. Współzmienne będą obejmować wiek, płeć, seropozytywność wobec H. pylori, poziom wykształcenia, palenie tytoniu, zażywanie tabaki i picie alkoholu. Zbadane zostanie również łączne działanie różnych metabolitów i interakcje z innymi zmiennymi towarzyszącymi.