Studieren von Tumorproben von jungen Patienten mit Neuroblastom

Studiensubtyp: Ergänzende/korrelative Beobachtung Studienmodell: Kohortenzeitperspektive: Retrospektive Bioprobenaufbewahrung: Proben mit DNA Bioprobenbeschreibung: Gewebestudienpopulation Beschreibung: Patienten, die zuvor in die klinische Studie COG-ANBL00B1 aufgenommen wurden Stichprobenmethode: Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

HAUPTZIEL:

I. Umfassendes Identifizieren und Charakterisieren des Spektrums und der Häufigkeit von Mutationen in ALK über alle Untergruppen von Neuroblastomerkrankungen hinweg unter Verwendung von Methoden, die für die Neuroblastom-Nukleinsäurebank der Children's Oncology Group ressourcenneutral sind.

SEKUNDÄRE ZIELE:

I. Um genetische Screening-Empfehlungen für neu diagnostizierte Patienten mit oder ohne Neuroblastom in der Familienanamnese zu formulieren.

II. Identifizierung der funktionell relevanten ALK-Mutationen, die pharmakologisch gehemmt werden können.

III. Um die Prognosefähigkeit von ALK-Veränderungen zu testen. IV. Bestimmung der klinischen Bedeutung von ALK-Mutationen und/oder genomischen Umlagerungen durch Kombinieren von ALK-Mutations-, Amplifikations- und Translokationsdaten insgesamt und innerhalb jeder Neuroblastom-Risikogruppe und Korrelieren dieser Informationen mit dem klinischen Phänotyp (d. h. Alter, Stadium des International Neuroblastoma Staging System und International Klassifikation der Pathologie des Neuroblastoms); genetische Faktoren (d. h. Ploidie, MYCN-Status); und Patientenergebnis.

UMRISS:

Tumor-DNA-Proben werden durch Mutationsanalyse auf Keimbahn- und somatische Mutationen in der ALK-Tyrosinkinase-Domäne untersucht. Die Proben werden durch Amplifikation des gesamten Genoms unter Verwendung der Polymerase-Kettenreaktion analysiert und dann auf DNA-Veränderungen in der gesamten ALK-codierenden Sequenz sequenziert. Die Proben werden auch durch Polymorphismusanalyse auf Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs) untersucht. Eine explorative multivariable Analyse wird durchgeführt, um die prognostische Fähigkeit von ALK-Mutationen in Gegenwart anderer bekannter prognostischer Variablen (d. h. Alter, Stadium des International Neuroblastoma Staging System, MYCN-Status, International Neuroblastoma Pathology Classification und Diploidie) zu testen.

Eine Teilmenge von Tumor-DNA-Proben von Hochrisikopatienten wird auf DNA-Veränderungen erneut sequenziert, um festzustellen, ob zusätzliche Regionen in ALK außerhalb der Tyrosinkinase-Domäne für Mutationen anfällig sind und in einem größeren Panel sequenziert werden sollten.