Neuroblasztómában szenvedő fiatal betegek daganatmintáinak tanulmányozása

Vizsgálat altípusa: Kiegészítő/korrelatív megfigyelési vizsgálati modell: Kohorszidő-perspektíva: Retrospektív biominta-visszatartás: DNS-biomintát tartalmazó minták Leírás: Szövetvizsgálati populáció leírása: Korábban COG-ANBL00B1 klinikai vizsgálatba bevont betegek Mintavételi Pro módszer: Mintavételi módszer:

AZ ELSŐDLEGES CÉLKÍTŰZÉS:

I. Az ALK mutációk spektrumának és gyakoriságának átfogó azonosítása és jellemzése az összes neuroblasztóma betegség alcsoportban olyan módszerekkel, amelyek erőforrás-semlegesek a Children's Oncology Group Neuroblastoma Nucleic Acids Bank számára.

MÁSODLAGOS CÉLKITŰZÉSEK:

I. Genetikai szűrési ajánlások megfogalmazása újonnan diagnosztizált betegek számára, akiknek a családjában előfordult neuroblasztóma vagy nem.

II. A funkcionálisan releváns ALK mutációk azonosítása, amelyek farmakológiailag gátolhatók.

III. Az ALK elváltozások prognosztikai képességének tesztelése. IV. Az ALK-mutációk és/vagy genomiális átrendeződések klinikai jelentőségének meghatározása az ALK-mutációs, amplifikációs és transzlokációs adatok általános és minden egyes neuroblasztóma kockázati csoporton belüli kombinálásával, és ezen információknak a klinikai fenotípussal (azaz az életkorral, a Nemzetközi Neuroblasztóma Staging System stádiumával és a Nemzetközivel) Neuroblasztóma patológia osztályozása); genetikai tényezők (azaz ploiditás, MYCN-státusz); és a beteg kimenetele.

VÁZLAT:

A tumor DNS-mintákat mutációs elemzéssel vizsgálják csíravonal és szomatikus mutációkra az ALK tirozin kináz doménben. A mintákat teljes genom amplifikációval elemezzük polimeráz láncreakció alkalmazásával, majd szekvenáljuk a teljes ALK kódoló szekvencia DNS-elváltozásait. A mintákat polimorfizmusanalízissel is megvizsgálják az egynukleotidos polimorfizmusok (SNP-k) szempontjából. Feltáró többváltozós elemzést végeznek az ALK-mutációk prognosztikai képességének tesztelésére más ismert prognosztikai változók (azaz életkor, nemzetközi neuroblasztóma stádiumrendszer stádiuma, MYCN státusz, nemzetközi neuroblasztóma patológia osztályozás és diploidia) jelenlétében.

A magas kockázatú betegekből származó tumor DNS-minták egy részhalmazát újraszekvenálják a DNS-elváltozások szempontjából, hogy megállapítsák, hogy az ALK-ban a tirozin-kináz doménen kívüli további régiói hajlamosak-e a mutációkra, és ezeket egy nagyobb panelben kell szekvenálni.