Neue Ziele durch proteomische Ansätze finden (InnovRT1) (InnovRT1)

Kontext: Rhaboidtumoren (RT) sind aggressive Krebsarten bei jungen Säuglingen, die der Toxizität schwerer, oft wirkungsloser Behandlungen ausgesetzt sind, was die Notwendigkeit der Entwicklung neuer Behandlungsstrategien rechtfertigt. Diese Tumoren sind durch die biallelische Veränderung des SMARCB1-Gens gekennzeichnet, das eine der Untereinheiten des SWI/SNF-Komplexes, einen Chromatin-Remodeler, kodiert. Diese Mutationen sind die einzigen, die bei diesen sehr stabilen Krebsarten gefunden werden, die nur wenige therapeutische Angriffspunkte bieten, die durch genomische Techniken identifiziert werden können. Sie sind morphologisch undifferenziert und pluriphänotypisch, was auf die Existenz einer noch wenig beschriebenen zellulären Diversität schließen lässt. Um diese Fragen voranzutreiben, hat das Labor der Forscher ein Modell eines gentechnisch veränderten Mausmodells entwickelt, das spontan RT entwickelt und seinen menschlichen Gegenstücken biologisch sehr ähnlich ist.

Ziele und Methoden: Das Projekt der Forscher zielt darauf ab, die proteomischen und phosphoproteomischen Signaturen dieser Tumoren zu beschreiben, bisher auf Genom- und Transkriptomebene beschrieben; Durch die Integration dieser pangenomischen/panproteomischen Studien werden die relevantesten Zielmerkmale ermittelt. Die Forscher werden die proteomische und phosphoproteomische Landschaft mithilfe von Massenspektrometrie vollständig charakterisieren Kohorte klinisch, radiologisch und histopathologisch annotierter ATRT, für die auch Methylom- und RNAseq-Profiling durchgeführt wird. Die Forscher werden die proteomischen Merkmale jeder molekular definierten Untergruppe beschreiben und darauf abzielen, RNAseq-Änderungen mit proteomischen Merkmalen zu korrelieren.

Patienten werden eingeschlossen, wenn sie oder ihr gesetzlicher Vertreter einer solchen Studie zugestimmt haben und wenn gefrorenes Material im Necker Hospital gelagert wird.

Erwartete Ergebnisse: Diese Analyse hilft dabei, herauszufinden, wie mehrere innovative Therapieansätze formuliert werden können, wobei sowohl die Vielfalt der zu behandelnden Zellen als auch die tatsächlichen Ziele, nämlich Proteine, zur Hemmung oder Wiederherstellung berücksichtigt werden.