M. Avium WGS während der Mav-PD-Behandlung

Mycobacterium Avium complex (MAC) sind eine Untergruppe nichttuberkulöser Mykobakterien (NTM), die typischerweise im Boden und im Wasser vorkommen und Lungenerkrankungen verursachen können. Die Behandlung von MAC ist eine Herausforderung, da sie typischerweise den Einsatz von drei oder mehr Antibiotika über einen langen Zeitraum erfordert und die Eradikationsrate nicht optimal ist.

Mac-WGS ist eine Beobachtungsstudie, die darauf abzielt zu verstehen, ob neue Stämme von M. avium für anhaltend kulturpositives Sputum während der Behandlung verantwortlich sind. Während der Dauer der Studie wird eine vollständige Genomsequenzierung (WGS) an M. avium-Isolaten aus dem Sputum von Patienten mit Mav-PD durchgeführt. Darüber hinaus werden häusliche Umgebungsproben gesammelt und sequenziert, um etwaige häusliche Infektionsquellen zu identifizieren.

Als Beobachtungsstudie erhalten die Teilnehmer nach Ermessen des Arztes eine routinemäßige Standardbehandlung. Zur Standardversorgung gehört die monatliche Abgabe von Sputum. Der aus dem Sputum vor der Behandlung und alle drei Monate während der Behandlung isolierte M. avium (bis das Sputum kulturnegativ wird) wird von WGS analysiert. Wird das Sputum erneut kulturpositiv, wird der isolierte Keim zusätzlich mittels Ganzgenomsequenzierung analysiert. Es wird festgestellt, ob immer der identische Stamm von M. avium vorhanden ist oder ob mehr als ein Stamm vorhanden ist, was auf eine Infektion mit mehreren Stämmen oder den Erwerb neuer M. avium-Stämme während der Behandlung schließen lässt. Zusätzlich wurden Umweltproben aus der häuslichen Umgebung des Teilnehmers (d. h. Wasserhähne und Duschkopf-Biofilme) werden kultiviert, um festzustellen, ob M. avium wiederhergestellt werden kann. Wenn ja, wird es mit WGS analysiert, um festzustellen, ob es sich um denselben Stamm wie im Sputum des Teilnehmers handelt.