M. Avium WGS tijdens Mav-PD-behandeling

Mycobacterium Avium-complex (MAC) is een subset van niet-tuberculeuze mycobacteriën (NTM) die doorgaans in de bodem en het water worden aangetroffen en longlongziekte kunnen veroorzaken. De behandeling van MAC is een uitdaging, omdat hiervoor doorgaans drie of meer antibiotica gedurende een lange periode nodig zijn en de uitroeiingssnelheid niet optimaal is.

Mac-WGS is een observationeel onderzoek dat tot doel heeft te begrijpen of nieuwe stammen van M. avium verantwoordelijk zijn voor aanhoudend kweekpositief sputum tijdens de behandeling. Gedurende de looptijd van het onderzoek zal Whole Genome Sequencing (WGS) worden uitgevoerd op M. avium-isolaten uit het sputum van patiënten met Mav-PD. Bovendien zullen er thuisomgevingsmonsters worden verzameld en gesequenced om eventuele infectiebronnen thuis te identificeren.

Als observationeel onderzoek krijgen de deelnemers een routinematige standaardzorgbehandeling, naar goeddunken van de arts. De zorgstandaard omvat maandelijkse sputuminzendingen. De M. avium die vóór de behandeling uit het sputum wordt geïsoleerd en tijdens de behandeling elke drie maanden (tot het moment dat het sputum cultuurnegatief wordt) zal door WGS worden geanalyseerd. Als het sputum weer kweekpositief wordt, zal de geïsoleerde kiem ook worden geanalyseerd door middel van volledige genoomsequencing. Er zal worden bepaald of de identieke stam van M. avium altijd aanwezig is of dat er meer dan één stam aanwezig is, wat zou kunnen wijzen op een infectie met meerdere stammen of op de verwerving van nieuwe stammen van M. avium tijdens de behandeling. Bovendien werden de thuismilieumonsters van de deelnemer (d.w.z. kranen en douchekopbiofilms) zullen worden gekweekt om te bepalen of M. avium kan worden teruggevonden en als dat het geval is, zal het worden geanalyseerd met WGS om te beoordelen of het dezelfde stam is als in het sputum van de deelnemer.