M. Avium WGS во время лечения Mav-PD

Комплекс Mycobacterium Avium (MAC) представляет собой подмножество нетуберкулезных микобактерий (НТМ), которые обычно обнаруживаются в почве и воде и могут вызывать легочные заболевания. Лечение МАК является сложной задачей, поскольку оно обычно требует применения трех или более антибиотиков в течение длительного периода времени, а скорость эрадикации субоптимальна.

Mac-WGS — это обсервационное исследование, целью которого является выяснить, вызывают ли новые штаммы M. avium устойчиво положительную культуральную мокроту во время лечения. Полногеномное секвенирование (WGS) будет проводиться на изолятах M. avium из мокроты пациентов с Mav-PD в течение всего исследования. Кроме того, будут собраны и секвенированы образцы домашней окружающей среды для выявления любого домашнего источника инфекции.

В рамках наблюдательного исследования участники будут получать обычное стандартное лечение по усмотрению врача. Стандарт медицинского обслуживания включает ежемесячную сдачу мокроты. M. avium, выделенный из мокроты перед лечением и каждые три месяца во время лечения (до тех пор, пока мокрота не станет отрицательной по культуре), будет анализироваться с помощью WGS. Если мокрота снова станет положительной по культуре, изолированный микроб также будет проанализирован с помощью полногеномного секвенирования. Будет определено, всегда ли присутствует идентичный штамм M. avium или присутствует более одного штамма, что может указывать на мультиштаммовую инфекцию или приобретение новых штаммов M. avium во время лечения. Кроме того, образцы домашней окружающей среды участника (т.е. биопленки из кранов и насадки для душа) будут культивированы, чтобы определить, можно ли восстановить M. avium, и если да, то они будут проанализированы с помощью WGS, чтобы оценить, является ли это тот же штамм, что и в мокроте участника.