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Secuenciación Metagenómica de Próxima Generación para el Diagnóstico de Infección Relacionada con Fractura (METADIAG 2)

Contribución de la Secuenciación Metagenómica mediante Tecnología Nanopore a la Gestión de Infecciones Óseas y Articulares Postraumáticas

El valor de la secuenciación de nueva generación (NGS) mediante la tecnología Nanopore se ha demostrado en el caso de heridas de pacientes diabéticos o en infecciones de prótesis articulares. El objetivo de este estudio es demostrar su relevancia como un nuevo enfoque diagnóstico para infecciones relacionadas con fracturas (FRI).

Las muestras óseas de pacientes con FRI se someterán a secuenciación de nueva generación metagenómica de escopeta utilizando la tecnología Oxford Nanopore (ONT) para establecer su valor diagnóstico en este contexto en comparación con el método de referencia.

Descripción general del estudio

Estado

Terminado

Condiciones

Intervención / Tratamiento

Descripción detallada

Se recuperarán muestras de tejido de pacientes con FRI utilizadas para cultivo rutinario y que queden después de este paso para realizar secuenciación metagenómica.

Se realizarán tanto los pasos de extracción de ADN como de eliminación de ADN del huésped. Se utilizará el protocolo de secuenciación por ligación de nanoporos junto con códigos de barras nativos para llevar a cabo la preparación de la librería de ADN. La secuenciación se ejecutará utilizando el dispositivo ONT GridION. Las lecturas generadas se informatizarán para ser asignadas en cada nivel taxonómico. Los resultados se compararán con los del diagnóstico rutinario para determinar la concordancia de la NGS con el cultivo.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Actual)

100

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

    • Bouches-du-Rhône
      • Marseille, Bouches-du-Rhône, Francia, 13005
        • IHU, service des maladies infectieuses chroniques
    • VAR
      • Toulon, VAR, Francia, 83000
        • Military Teaching Hospital Sainte Anne

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

  • Adulto
  • Adulto Mayor

Acepta Voluntarios Saludables

No

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

Pacientes ingresados en el hospital tras un traumatismo a los que se les diagnosticó una infección relacionada con la fractura.

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Edad ≥ 18 años
  • Diagnóstico de infección relacionada con fractura (grupo de consenso FRI)
  • Paciente programado para someterse a una biopsia ósea y/o de tejidos blandos como parte de la atención de rutina

Criterios de exclusión:

  • Oposición del paciente
  • Paciente bajo una medida de protección legal.

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
Intervención / Tratamiento
Infección relacionada con la fractura
Pacientes con sospecha de infección osteoarticular postraumática aguda o crónica según los criterios del grupo de consenso FRI (Fracture-Related Infection) y programados para someterse a una biopsia ósea y/o de tejido blando como parte de la atención rutinaria
Las muestras se someterán a una secuenciación de alto rendimiento con illumine MiSeq y Oxford Nanopore Technologies.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Concordancia entre la documentación microbiológica obtenida mediante secuenciación y la de la técnica de referencia (cultivo)
Periodo de tiempo: 1 mes

La secuenciación metagenómica se utilizará para determinar el microbioma de las infecciones relacionadas con fracturas.

Los datos se compararán con los de las técnicas de identificación microbiológica de referencia (cultivo).

1 mes

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Tiempo para obtener resultados microbiológicos finales mediante secuenciación en comparación con la técnica de referencia (cultivo)
Periodo de tiempo: 1 mes
Duración (en días) para el diagnóstico microbiológico definitivo utilizando tanto protocolos basados en cultivo como en NGS.
1 mes
Número de casos en los que se realizaría un ajuste de la terapia antibiótica dirigida basándose en los resultados de NGS.
Periodo de tiempo: 1 mes
Número de casos en los que se realizaría un ajuste de la terapia antibiótica dirigida basándose en los resultados de NGS.
1 mes
Abundancia microbiana definida por el número de lecturas (lecturas de secuencia) obtenidas por filotipo
Periodo de tiempo: 1 mes
Describir el microbioma de la infección relacionada con fracturas en términos de diversidad y abundancia microbiana para discutir tanto el número de lecturas brutas como el papel de la abundancia relativa al considerar los resultados de NGS en este contexto.
1 mes

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Patrocinador

Colaboradores

Investigadores

  • Director de estudio: LACÔTE-DELARBRE David, MD, Military Teaching Hospital Sainte Anne

Publicaciones y enlaces útiles

La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

11 de marzo de 2024

Finalización primaria (Actual)

31 de diciembre de 2025

Finalización del estudio (Actual)

31 de diciembre de 2025

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

20 de noviembre de 2025

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

20 de noviembre de 2025

Publicado por primera vez (Actual)

1 de diciembre de 2025

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

7 de julio de 2026

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

6 de julio de 2026

Última verificación

1 de julio de 2025

Más información

Términos relacionados con este estudio

Términos MeSH relevantes adicionales

Otros números de identificación del estudio

  • 2023-CHITS-017

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

NO

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

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