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Metagenómica de Sequenciação de Nova Geração para o Diagnóstico de Infeção Relacionada com Fratura (METADIAG 2)

Contribuição da Sequenciação Metagenómica Utilizando Tecnologia Nanopore para a Gestão de Infeções Ósseas e Articulares Pós-traumáticas

O valor do sequenciamento de próxima geração (NGS) utilizando a tecnologia Nanopore foi demonstrado no caso de feridas de doentes diabéticos ou em infeções de próteses articulares. O objetivo deste estudo é demonstrar a sua relevância como uma nova abordagem de diagnóstico para infeções relacionadas com fraturas (FRI).

Amostras ósseas de doentes com FRI serão submetidas a sequenciamento metagenómico shotgun de próxima geração utilizando a tecnologia Oxford Nanopore (ONT) para estabelecer o seu valor de diagnóstico neste contexto em comparação com o método de referência.

Visão geral do estudo

Status

Concluído

Condições

Intervenção / Tratamento

Descrição detalhada

As amostras de tecido de doentes com FRI utilizadas para cultura de rotina e as restantes após esta etapa serão recuperadas para sequenciação metagenómica.

Serão realizados tanto os passos de extração de ADN como de depleção de ADN do hospedeiro. O protocolo de sequenciação por ligação de nanoporos juntamente com a codificação por código de barras nativo será utilizado para realizar a preparação da biblioteca de ADN. A sequenciação será executada utilizando o dispositivo ONT GridION. As leituras geradas serão informatizadas para serem atribuídas a cada nível taxonómico. Os resultados serão comparados com os do diagnóstico de rotina para determinar a concordância do NGS com a cultura.

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Real)

100

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Locais de estudo

    • Bouches-du-Rhône
      • Marseille, Bouches-du-Rhône, França, 13005
        • IHU, service des maladies infectieuses chroniques
    • VAR
      • Toulon, VAR, França, 83000
        • Military Teaching Hospital Sainte Anne

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

  • Adulto
  • Adulto mais velho

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Método de amostragem

Amostra Não Probabilística

População do estudo

Doentes admitidos no hospital após trauma, a quem foi diagnosticada uma infeção relacionada com a fratura.

Descrição

Critérios de Inclusão:

  • Idade ≥ 18 anos
  • Diagnóstico de infeção relacionada com fratura (grupo de consenso FRI)
  • Paciente agendado para realizar uma biópsia óssea e/ou de tecidos moles como parte dos cuidados de rotina

Critérios de Exclusão:

  • Oposição do paciente
  • Paciente sob medida de proteção legal.

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Intervenção / Tratamento
Infeção relacionada com fratura
Pacientes com suspeita de infeção osteoarticular aguda ou crónica pós-traumática de acordo com os critérios do grupo de consenso FRI (Fracture-Related Infection) e agendados para realizar uma biópsia óssea e/ou de tecidos moles como parte dos cuidados de rotina
As amostras serão submetidas a sequenciamento de alto rendimento usando as tecnologias illumine MiSeq e Oxford Nanopore.

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Concordância entre a documentação microbiológica obtida por sequenciação e a da técnica de referência (cultura)
Prazo: 1 mês

A sequenciação metagenómica será utilizada para determinar o microbioma das infeções relacionadas com fraturas.

Os dados serão comparados com os das técnicas de identificação microbiológica de referência (cultura).

1 mês

Medidas de resultados secundários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Tempo para obter os resultados microbiológicos finais por sequenciação em comparação com a técnica de referência (cultura)
Prazo: 1 mês
Duração (em dias) para diagnóstico microbiológico definitivo utilizando protocolos baseados em cultura e NGS.
1 mês
Número de casos em que um ajuste da antibioticoterapia dirigida seria efetuado com base nos resultados do NGS.
Prazo: 1 mês
Número de casos em que um ajuste da terapia antibiótica direcionada seria feito com base nos resultados do NGS.
1 mês
Abundância microbiana definida pelo número de leituras (sequências lidas) obtidas por filótipo
Prazo: 1 mês
Descrever o microbioma da infeção relacionada com fratura em termos de diversidade e abundância microbiana, de modo a discutir tanto o número de leituras brutas como o papel da abundância relativa ao considerar resultados de NGS neste contexto.
1 mês

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Patrocinador

Colaboradores

Investigadores

  • Diretor de estudo: LACÔTE-DELARBRE David, MD, Military Teaching Hospital Sainte Anne

Publicações e links úteis

A pessoa responsável por inserir informações sobre o estudo fornece voluntariamente essas publicações. Estes podem ser sobre qualquer coisa relacionada ao estudo.

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

11 de março de 2024

Conclusão Primária (Real)

31 de dezembro de 2025

Conclusão do estudo (Real)

31 de dezembro de 2025

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

20 de novembro de 2025

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

20 de novembro de 2025

Primeira postagem (Real)

1 de dezembro de 2025

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Real)

7 de julho de 2026

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

6 de julho de 2026

Última verificação

1 de julho de 2025

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Termos MeSH relevantes adicionais

Outros números de identificação do estudo

  • 2023-CHITS-017

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

NÃO

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .