Estudio de reproducibilidad del proyecto Spartan FRX

El sistema FRX se compone de hardware y componentes consumibles. Los componentes de hardware del sistema incluyen un analizador (ciclador térmico con capacidad de detección de fluorescencia), una computadora portátil y una impresora. El componente consumible del sistema FRX es un kit de recolección de muestras. Cada kit contiene un hisopo bucal (utilizado para recolectar la muestra del paciente) y un tubo que contiene los reactivos necesarios para la extracción de ADN genómico y las etapas de amplificación de la prueba mediante PCR (reacción en cadena de la polimerasa).

El Spartan FRX System es capaz de detectar tres CYP2C19 SNP (polimorfismo de un solo nucleótido) (*2, *3, *17) en cada prueba realizada. Se requiere un kit de recolección de muestras individual para cada SNP analizado; por lo tanto, se requieren tres kits de recolección de muestras para cada prueba realizada en el sistema.

Para realizar una prueba, el usuario recolecta tres muestras bucales del paciente y luego inserta una muestra en cada uno de los tres tubos de reactivos (uno para cada uno de los loci CYP2C19 *2, *3 y *17). Los tubos de reactivos se colocan en el analizador y el sistema FRX automatiza los procesos de extracción de ADN, amplificación por PCR, detección de señales fluorescentes y análisis de datos. El sistema proporciona al usuario un resultado impreso que enumera los genotipos de los pacientes en los loci *2, *3 y *17.

El objetivo del estudio es evaluar el desempeño del Sistema FRX bajo condiciones multivariadas. En concreto, se incluirán en el estudio las siguientes variables:

• Sitio de prueba - x3
• Operador - x6 (2 por sitio)
• Día - x15 (5 días no consecutivos por sitio)
• Sistema FRX-x16

El rendimiento de la prueba se define como el número de llamadas de genotipo correctas, expresado como un porcentaje del número total de pruebas realizadas en el sistema.

Tanto para los resultados de la primera pasada como de la segunda pasada, los límites inferiores unilaterales del 95 % de confianza se calcularán utilizando el método de puntuación para el % de llamadas correctas (es decir, el % de acuerdo).

Los resultados del genotipo del sistema FRX se compararán con los resultados de la secuenciación del ADN. Se determinará que el resultado de la prueba del sistema FRX es correcto si el genotipo requiere que los tres SNP sean idénticos a los genotipos determinados por secuenciación de ADN para esa muestra/individuo.

Los resultados del estudio de reproducibilidad serán aceptables si el límite inferior de un límite de confianza unilateral del 95 % de la tasa total de llamadas correctas por genotipo es mayor o igual al 95 %, según los resultados del segundo paso.