Mitokondriotaudit - Pitkään luetun genomin ja transkription sekvensointi tapauksissa, joita ei ole ratkaistu lyhyen genomitutkimuksen jälkeen

MiDiSeq-projektissa (monocentric, prospective, open-label diagnostic) potilaat, joilla epäillään mitokondriosairauksia, asettivat etusijalle i) suuren a priori todennäköisyyden geneettisen perusteella (esim. positiivinen sukuhistoria) sekä (ii) fibroblastisolulinjojen, joilla on biokemiallisesti määritelty fenotyyppi, saatavuus, (iii) vanhempainnäytteet, (iv) lyhyesti luettavat koko genomi- ja transkriptiotietojoukot ja (v) valinnaiset metabolomiikka- ja proteomiikkatiedot.

Seuraavat kysymykset ohjaavat projektia:

i) vertailla järjestelmällisesti erilaisia ​​sekvensointitekniikoita geneettisen ja epigeneettisen variaation ja niiden vaikutuksen geenisäätelyyn havaitsemiseksi.

(ii) kehittää edelleen algoritmeja erilaisten omics-aineistojen integratiivisiin analyyseihin.

(iii) laajentaa analyysia koodaavista yhden nukleotidin muunnelmista (SNV:t) ja säätelymutaatioista rakennemuunnelmiin (SV:t), toistuviin laajennuksiin ja supistuksiin, matalan kompleksisuuden alueisiin ja epigeneettisiin allekirjoituksiin.

(iv) tunnistaa uusia muutoksia ja sairausmekanismeja. (v) saada perustavanlaatuisia uusia näkemyksiä sairausmekanismeista ja solubiologiasta.

(vi) parantaa tulevien harvinaisia ​​sairauksia sairastavien potilaiden geneettistä diagnostiikkaa ja arvioida yksilöllisiä hoitovaihtoehtoja.