DNA:n tutkiminen kasvainkudosnäytteissä potilailta, joilla on paikallinen tai metastaattinen osteosarkooma
Metastaattisen osteosarkooman genominen tutkimus seuraavan sukupolven sekvensointiteknologialla
PERUSTELUT: Syöpäpotilaiden kasvainkudos- ja verinäytteiden tutkiminen laboratoriossa voi auttaa lääkäreitä oppimaan lisää DNA:ssa tapahtuvista muutoksista ja tunnistamaan syöpään liittyviä biomarkkereita.
TARKOITUS: Tässä tutkimustutkimuksessa tarkastellaan DNA:ta kasvainkudosnäytteistä potilailta, joilla on paikallinen tai metastaattinen osteosarkooma.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
TAVOITTEET:
- Määritä genominen ilmentymisprofiili kasvainkudosnäytteistä potilailta, joilla on paikallinen tai metastaattinen osteosarkooma, käyttämällä transkriptisekvensointia.
- Tunnista aktivoituvat ja menettävät funktiomutaatiot ja geenien uudelleenjärjestely näistä kasvainkudosnäytteistä käyttämällä transkriptiosekvenssiä.
- Tunnista ehdokasgeenit, jotka ovat tärkeitä osteosarkoomassa ja tuumorigeneesissä käyttämällä genomin jakautumisstrategioita genomisen DNA:n sekvensointiin.
- Tunnista, mitkä mutaatiot liittyvät tulokseen.
- Selvitä, mitkä mutaatiot löytyvät myös itulinjan DNA:sta, jotka altistavat potilaan osteosarkoomalle.
YHTEENVETO: DNA:ta ja RNA:ta tallennetuista kasvainkudosnäytteistä sekä DNA-pariverinäytteistä analysoidaan sekvensointitutkimuksissa seuraavan sukupolven sekvensointiteknologialla. Näistä kasvainnäytteistä saadut sekvensointitiedot yhdistetään Human RefSeq:iin (transkriptomin sekvensointia varten) ja normaaliin ihmisen genomiin julkisissa tietokannassa sekä potilaan ituradan sekvenssiin perustuslaillisten ja somaattisten mutaatioiden tunnistamiseksi.
Myös kuhunkin näytteeseen liittyvät kliiniset tiedot (eli ikä, kasvainkohta, koko, primaariset etäpesäkkeet, vaste kemoterapiaan, kirurginen remissio, seuranta-aika ja hoitoprotokolla) kerätään, jos niitä on saatavilla.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
TAUDEN OMINAISUUDET:
- Paikallisen tai metastaattisen osteosarkooman diagnoosi
- Saatavilla tallennetut pikapakastetut kasvainkudosnäytteet ja parilliset veri-DNA-näytteet
POTILAS OMINAISUUDET:
- Ei määritelty
EDELLINEN SAMANAIKAINEN HOITO:
- Ei määritelty
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
|---|
|
Genominen ilmentymisprofiili osteosarkooman kasvainnäytteissä käyttämällä transkriptisekvensointia
|
|
Aktivoituvien ja toiminnallisten mutaatioiden sekä geenien uudelleenjärjestelyjen tunnistaminen transkriptomisekvensoinnilla
|
|
Lopputulokseen liittyvät mutaatiot
|
|
Mutaatioita löytyy myös itulinjan DNA:sta, jotka altistavat potilaan osteosarkoomalle
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Javed Khan, MD, NCI - Oncogenomics Section
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Arvio)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- AOST10B3
- COG-AOST10B3 (Muu tunniste: Children's Oncology Group)
- CDR0000665327 (Muu tunniste: Clinical Trials.gov)
- NCI-2011-02210 (Rekisterin tunniste: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .