Alueidenvälinen hanke Great Western Exploration lähestymistapaa varten Exome-molekyylin aiheuttamien vakavan älyllisen vamman eristyksissä tai oireyhtymässä (HUGODIMS)
tiistai 11. joulukuuta 2018 päivittänyt: Nantes University Hospital
Keskivaikea tai vaikea älyllinen vamma vaikuttaa noin yhteen lapseen 250:stä, ja uusia tapauksia tulee vuosittain 3000–4000.
Kromosomi- tai molekyylipatologian syitä ei tunnisteta puolessa tapauksista nykyisillä tekniikoilla.
Tutkimukset osoittavat, että de novo -mutaatiot ovat yleisiä monissa eri geeneissä.
"Exome"-lähestymistapa high-throughput sekvensoinnilla (NGS) on noussut valituksi tekniikaksi lapsen ja vanhemman eksomin tunnistamisessa ja vertailussa.
Haluamme arvioida tätä lähestymistapaa ja sen osuutta 50 potilaan diagnostisessa hallinnassa, joilla on DI:n genetiikka 6 CHU:n Great Westissä.
Genomiikka-alusta IBISA / Biogenouest tarjoaa teknologian ja bioinformatiikan tukea tälle projektille.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Valmis
Ehdot
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Todellinen)
228
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
Angers, Ranska, 49933
- Angers University Hospital
-
Brest, Ranska, 29609
- Brest University Hospital
-
Poitiers, Ranska, 86021
- Poitiers University Hospital
-
Rennes, Ranska, 35203
- Rennes University Hospital
-
Tours, Ranska, 37044
- Tours University Hospital
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Suunnittelimme mukaan tutkimukseen 50 triota (potilaat + vanhemmat). Tämä luku näyttää riittävältä asetettujen tavoitteiden saavuttamiseen ja kirjallisuuden tietojen mukaan (Rauch et al, 2012).
Tutkimuspopulaatio on väestö, jolla on yleisesti hyväksytyn määritelmän mukainen vaikea kehitysvamma (IQ <35) ja potilaat, joilla on vaikea tai kohtalainen ID (IQ <50), johon liittyy muita kliinisiä oireita, mutta ilmeistä syndroomaa ei tunneta. Kahdessa tapauksessa DI ei vaikuta potilaiden vanhempiin. Rekrytointi tehdään geneettisen neuvonnan aikana. Monia tutkimuksen kriteerit täyttäviä DI-potilaita tutkitaan jo nyt eri keskuksissa. Näille potilaille indeksitapauksen ja vanhempien DNA on jo saatavilla. Tästä syystä perheisiin otetaan uudelleen yhteyttä ja pyydetään heitä osallistumaan tähän tutkimukseen.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Potilaat, joilla on vaikea kehitysvamma (IQ <35) tai kohtalainen (IQ <50) eristetty tai oireyhtymä, mutta diagnosoimaton. Diagnoosi vahvistetaan 6 CHU:n välisen alueen geneettisen neuvonnan aikana
- Sukuhistorian puute (vanhemmat). Olemme kiinnostuneita tästä hankkeesta potilaille, joilla ei ole sukuhistoriaa, jotta voidaan lisätä de novo - mutaation tunnistamisen todennäköisyyttä. Emme kuitenkaan sulje pois hypoteesia joidenkin potilaiden kohdalla resessiivisestä autosomaalisesta tai X-kytketystä mekanismista.
- Rekrytointi 6 CHU HUGOssa. Potilaiden on oltava geneettisesti nähtyjä 6 CHU:n välisellä alueella. Fragile X -oireyhtymän ja CGH-tekniikan molekyylianalyysien on oltava negatiivisia.
- Tiedekomitean hyväksymä indikaatiojärjestyksen exomique. Tieteellisen komitean HUGODIMS-projektin tehtävänä on valita potilaita, joiden DNA:ta tutkitaan, jotta sekvensoinnin onnistumismahdollisuudet optimoidaan. Tässä valinnassa on otettava huomioon kliiniset parametrit, mutta myös geneettiset parametrit (mahdollinen sisäsiitos). Tiedostot valitaan videoneuvottelulla CLADin kuukausittaisen kokouksen lopussa. Tutkimuksen metodologi kutsutaan videoneuvotteluun.
- tutkimukselle saatu erityinen suostumus.
Poissulkemiskriteerit:
- Keskivaikeasta tai vaikeasta kehitysvammaisten potilaiden vanhemmat ovat eri mieltä de novo -mutaatiosta tai resessiivisestä transmissiomekanismista.
- Muoto, jolla on tunnettu oireyhtymädiagnoosi, voidaan kohdentaa molekyylitutkimuksiin (kliiniset merkit).
- Kohdistetulla molekyylianalyysillä tai CGH:lla tunnistettu molekyyli-DI.
- Selkeä kieltäytyminen osallistumasta potilaan, vanhempien tai jommankumman vanhemmista tutkimukseen.
- Kaikki muut merkit henkisestä vammasta.
- Potilaan tai potilaan vanhemmat voidaan poistaa.
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Perhepohjainen
- Aikanäkymät: Tulevaisuuden
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Aikaikkuna |
|---|---|
|
Niiden potilaiden lukumäärä, joille on tunnistettu de novo -potilaiden DI:n aiheuttaja mutaatio
Aikaikkuna: 18 kuukautta
|
18 kuukautta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Aikaikkuna |
|---|---|
|
Niiden potilaiden lukumäärä, joille eksomien tutkimus paljasti mutaatioita geeneissä, jotka ovat yhteensopivia resessiivisen autosomaalisen resessiivisen tai X-kytketyn kromosomin tilan kanssa
Aikaikkuna: 18 kuukautta
|
18 kuukautta
|
|
De novo -mutaatioiden lukumäärän (toiminnan menetys, missense tai indelit) todennäköisesti tunnistettujen patogeenien ei tiedetä liittyvän DI-geeneihin.
Aikaikkuna: 18 kuukautta
|
18 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Stéphane Bézieau, Pr, Nantes university hospital
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Maanantai 1. syyskuuta 2014
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Perjantai 1. tammikuuta 2016
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Perjantai 1. tammikuuta 2016
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Perjantai 9. toukokuuta 2014
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Perjantai 9. toukokuuta 2014
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Tiistai 13. toukokuuta 2014
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Keskiviikko 12. joulukuuta 2018
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Tiistai 11. joulukuuta 2018
Viimeksi vahvistettu
Tiistai 1. maaliskuuta 2016
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- RC14_0107
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .