- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT02171286
Oncopanel Pilot (TOP) -tutkimus
BCCA Oncopanel on kliininen määritys, jota kehitetään prospektiivisesti määritellyn geenijoukon genotyypin tilan määrittämiseksi.
Tämän pilottitutkimuksen tarkoituksena on arvioida Oncopanel-testin toteutettavuutta ja vaikutusta kliiniseen päätöksentekoon. Tukikelpoisia potilaita ovat ne, joilla on pitkälle edennyt keuhko-, paksusuolen- ja peräsuolen-, melanooma- ja GIST-syöpä, sekä potilaat, joilla on diagnosoitu pahanlaatuinen kasvain ja joita harkitaan kliinisissä tutkimuksissa.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Somaattiset mutaatiot kiinteissä kasvaimissa ovat vakiintunut tapa karakterisoida pahanlaatuisia kasvaimia ennuste-, diagnostisia ja terapeuttisia tarkoituksia varten. Mutaatiot EGFR-, KRAS-, BRAF- ja KIT- ja PDGFRA-geeneissä ohjaavat hoitoa potilailla, joilla on edennyt keuhko-, paksusuolen-, melanooma- ja GIST-kasvain. Tunnetut tai uudet mutaatiot muissa geeneissä voivat myös olla kliinisesti merkittäviä, mutta niitä ei tunnisteta nykyisellä BCCA-potilaille tarjottavalla genotyypiyksellä. Lisäksi lukuisia ehdokasgeenejä on liitetty mahdollisina prognostisina ja ennustavina biomarkkereina potilailla, joilla on kiinteitä kasvaimia. Sellaisenaan Oncopanel on kliininen määritys, jota kehitetään prospektiivisesti määritellyn geenijoukon genotyypin tilan määrittämiseksi. Seuraavat kliinisesti merkitykselliset geenit ja eksonit sisältyvät Oncpaneliin: KRAS, EGFR, BRAF, NRAS ja HRAS, PIK3CA-signaalisiirtoreitin geenit, RAS-RAF-MEK-MAPK-reitti, HER2, IDH1 ja IDH2, ALK, TP53, c-KIT, STAT1&3 ja PDGFRA. Kasvainmateriaalin lisätestaus sisältää myös haitallisiin tapahtumiin tai hoitovasteeseen liittyvien spesifisten geenivarianttien analyysin.
Lukuisat tutkimukset ovat dokumentoineet kiertävän kasvain-DNA:n (ctDNA) esiintymisen potilailla, joilla on pitkälle edennyt ja varhaisvaiheinen pahanlaatuinen kasvain (20-22). Kykyä diagnosoida standardisyövän mutaatioita veripohjaisella määrityksellä ("nestebiopsia") ei ole vielä vahvistettu, mutta sillä on ilmeisiä etuja. Metastaattisessa kasvaimessa tai hoidon aikana syntyvien "resistenssi"-mutaatioiden ilmaantuminen on hyvin dokumentoitu (21, 22). Veribiopsia voi edustaa tarkempaa määritystä kasvaimen geneettisistä ominaisuuksista kuin arkisto-DNA-näyte. Riittävien kudosnäytteiden saaminen voi olla vaikeaa joiltakin potilailta, joilla on diagnosoitu pahanlaatuinen syöpä, erityisesti keuhkosyöpä. Veribiopsia voi olla vähemmän invasiivinen ja oikea-aikaisempi tapa diagnosoida sekä standardi- että translaatiosyöpämutaatiot.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
British Columbia
-
Abbotsford, British Columbia, Kanada, V2S 0C2
- Abbotsford Centre, BC Cancer Agency
-
Kelowna, British Columbia, Kanada, V1Y5L3
- BC Cancer Agency - Centre for the Southern Interior
-
Surrey, British Columbia, Kanada, V3V 1Z2
- Fraser Valley Centre, BC Cancer Agency
-
Vancouver, British Columbia, Kanada, V5Z 4E6
- Vancouver Centre, BC Cancer Agency
-
Victoria, British Columbia, Kanada, V8R 6V5
- Vancouver Island Centre, BC Cancer Agency
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Potilaat, joilla on arkistoitu kasvainkudos ja joilla on tiedossa invasiivisia pahanlaatuisia kasvaimia, ovat kelpoisia, jos he täyttävät yhden tai useamman seuraavista kriteereistä:
- Pitkälle edennyt paksusuolen syöpä ja kelvollinen standardi KRAS-testiin,
- Pitkälle edennyt ei-pienisoluinen keuhkosyöpä, joka on kelvollinen standardi EGFR-testaukseen,
- Edistynyt melanooma ja kelvollinen standardi BRAF-testaukseen,
- Ruoansulatuskanavan stroomakasvaimet (GIST:t), jotka ovat kelvollisia standardinmukaiseen c-KIT- ja PDGFRA-testaukseen,
- Harkitaan mahdollisen kliinisen tutkimuksen kelpoisuuden osalta.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Ei hoitoa
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Aikaikkuna |
|---|---|
|
Päivien lukumäärä arkiston kasvainkudoksen vastaanottamisen ja OncoPanel-raportin luomisen välillä
Aikaikkuna: 10 arkipäivää
|
10 arkipäivää
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Aikaikkuna |
|---|---|
|
Prosenttiosuus tapauksista, joissa Oncopanel-raportti luodaan vastaanotetusta kasvainnäytteestä
Aikaikkuna: 1 vuosi
|
1 vuosi
|
Muut tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Aikaikkuna |
|---|---|
|
Prosenttiosuus tapauksista, joissa Oncopanelin tunnistama genotyyppilöydös toistetaan tavallisessa kliinisessä määrityksessä myöhemmän hoidon ohjaamiseksi
Aikaikkuna: 1 vuosi
|
1 vuosi
|
|
Prosenttiosuus potilaista, jotka osallistuivat hyväksyttyyn kliiniseen tutkimukseen, joka liittyy Oncopanel-tuloksiin
Aikaikkuna: 1 vuosi
|
1 vuosi
|
|
Oncopanel-tulosten ja ctDNA-sekvensoinnin välinen vastaavuus
Aikaikkuna: 1 vuosi
|
1 vuosi
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
- Päätutkija: Hagen Kennecke, MD, British Columbia Cancer Agency
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Green RC, Berg JS, Grody WW, Kalia SS, Korf BR, Martin CL, McGuire AL, Nussbaum RL, O'Daniel JM, Ormond KE, Rehm HL, Watson MS, Williams MS, Biesecker LG; American College of Medical Genetics and Genomics. ACMG recommendations for reporting of incidental findings in clinical exome and genome sequencing. Genet Med. 2013 Jul;15(7):565-74. doi: 10.1038/gim.2013.73. Epub 2013 Jun 20. Erratum In: Genet Med. 2017 May;19(5):606.
- Johnson DB, Dahlman KH, Knol J, Gilbert J, Puzanov I, Means-Powell J, Balko JM, Lovly CM, Murphy BA, Goff LW, Abramson VG, Crispens MA, Mayer IA, Berlin JD, Horn L, Keedy VL, Reddy NM, Arteaga CL, Sosman JA, Pao W. Enabling a genetically informed approach to cancer medicine: a retrospective evaluation of the impact of comprehensive tumor profiling using a targeted next-generation sequencing panel. Oncologist. 2014 Jun;19(6):616-22. doi: 10.1634/theoncologist.2014-0011. Epub 2014 May 5.
- Gray SW, Hicks-Courant K, Cronin A, Rollins BJ, Weeks JC. Physicians' attitudes about multiplex tumor genomic testing. J Clin Oncol. 2014 May 1;32(13):1317-23. doi: 10.1200/JCO.2013.52.4298. Epub 2014 Mar 24.
- Choi YL, Soda M, Yamashita Y, Ueno T, Takashima J, Nakajima T, Yatabe Y, Takeuchi K, Hamada T, Haruta H, Ishikawa Y, Kimura H, Mitsudomi T, Tanio Y, Mano H; ALK Lung Cancer Study Group. EML4-ALK mutations in lung cancer that confer resistance to ALK inhibitors. N Engl J Med. 2010 Oct 28;363(18):1734-9. doi: 10.1056/NEJMoa1007478.
- Doebele RC, Pilling AB, Aisner DL, Kutateladze TG, Le AT, Weickhardt AJ, Kondo KL, Linderman DJ, Heasley LE, Franklin WA, Varella-Garcia M, Camidge DR. Mechanisms of resistance to crizotinib in patients with ALK gene rearranged non-small cell lung cancer. Clin Cancer Res. 2012 Mar 1;18(5):1472-82. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-11-2906. Epub 2012 Jan 10.
- Guo J, Si L, Kong Y, Flaherty KT, Xu X, Zhu Y, Corless CL, Li L, Li H, Sheng X, Cui C, Chi Z, Li S, Han M, Mao L, Lin X, Du N, Zhang X, Li J, Wang B, Qin S. Phase II, open-label, single-arm trial of imatinib mesylate in patients with metastatic melanoma harboring c-Kit mutation or amplification. J Clin Oncol. 2011 Jul 20;29(21):2904-9. doi: 10.1200/JCO.2010.33.9275. Epub 2011 Jun 20.
- Chapman PB, Hauschild A, Robert C, Haanen JB, Ascierto P, Larkin J, Dummer R, Garbe C, Testori A, Maio M, Hogg D, Lorigan P, Lebbe C, Jouary T, Schadendorf D, Ribas A, O'Day SJ, Sosman JA, Kirkwood JM, Eggermont AM, Dreno B, Nolop K, Li J, Nelson B, Hou J, Lee RJ, Flaherty KT, McArthur GA; BRIM-3 Study Group. Improved survival with vemurafenib in melanoma with BRAF V600E mutation. N Engl J Med. 2011 Jun 30;364(26):2507-16. doi: 10.1056/NEJMoa1103782. Epub 2011 Jun 5.
- Newman AM, Bratman SV, To J, Wynne JF, Eclov NC, Modlin LA, Liu CL, Neal JW, Wakelee HA, Merritt RE, Shrager JB, Loo BW Jr, Alizadeh AA, Diehn M. An ultrasensitive method for quantitating circulating tumor DNA with broad patient coverage. Nat Med. 2014 May;20(5):548-54. doi: 10.1038/nm.3519. Epub 2014 Apr 6.
- Shi Y, Au JS, Thongprasert S, Srinivasan S, Tsai CM, Khoa MT, Heeroma K, Itoh Y, Cornelio G, Yang PC. A prospective, molecular epidemiology study of EGFR mutations in Asian patients with advanced non-small-cell lung cancer of adenocarcinoma histology (PIONEER). J Thorac Oncol. 2014 Feb;9(2):154-62. doi: 10.1097/JTO.0000000000000033.
- Misale S, Yaeger R, Hobor S, Scala E, Janakiraman M, Liska D, Valtorta E, Schiavo R, Buscarino M, Siravegna G, Bencardino K, Cercek A, Chen CT, Veronese S, Zanon C, Sartore-Bianchi A, Gambacorta M, Gallicchio M, Vakiani E, Boscaro V, Medico E, Weiser M, Siena S, Di Nicolantonio F, Solit D, Bardelli A. Emergence of KRAS mutations and acquired resistance to anti-EGFR therapy in colorectal cancer. Nature. 2012 Jun 28;486(7404):532-6. doi: 10.1038/nature11156.
- Punnoose EA, Atwal S, Liu W, Raja R, Fine BM, Hughes BG, Hicks RJ, Hampton GM, Amler LC, Pirzkall A, Lackner MR. Evaluation of circulating tumor cells and circulating tumor DNA in non-small cell lung cancer: association with clinical endpoints in a phase II clinical trial of pertuzumab and erlotinib. Clin Cancer Res. 2012 Apr 15;18(8):2391-401. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-11-3148. Epub 2012 Apr 5.
- Spindler KL, Pallisgaard N, Vogelius I, Jakobsen A. Quantitative cell-free DNA, KRAS, and BRAF mutations in plasma from patients with metastatic colorectal cancer during treatment with cetuximab and irinotecan. Clin Cancer Res. 2012 Feb 15;18(4):1177-85. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-11-0564. Epub 2012 Jan 6.
- Douillard JY, Oliner KS, Siena S, Tabernero J, Burkes R, Barugel M, Humblet Y, Bodoky G, Cunningham D, Jassem J, Rivera F, Kocakova I, Ruff P, Blasinska-Morawiec M, Smakal M, Canon JL, Rother M, Williams R, Rong A, Wiezorek J, Sidhu R, Patterson SD. Panitumumab-FOLFOX4 treatment and RAS mutations in colorectal cancer. N Engl J Med. 2013 Sep 12;369(11):1023-34. doi: 10.1056/NEJMoa1305275.
- Dienstmann R, Dong F, Borger D, Dias-Santagata D, Ellisen LW, Le LP, Iafrate AJ. Standardized decision support in next generation sequencing reports of somatic cancer variants. Mol Oncol. 2014 Jul;8(5):859-73. doi: 10.1016/j.molonc.2014.03.021. Epub 2014 Apr 4.
- Jimeno A, Messersmith WA, Hirsch FR, Franklin WA, Eckhardt SG. KRAS mutations and sensitivity to epidermal growth factor receptor inhibitors in colorectal cancer: practical application of patient selection. J Clin Oncol. 2009 Mar 1;27(7):1130-6. doi: 10.1200/JCO.2008.19.8168. Epub 2009 Jan 5.
- Lee CK, Brown C, Gralla RJ, Hirsh V, Thongprasert S, Tsai CM, Tan EH, Ho JC, Chu da T, Zaatar A, Osorio Sanchez JA, Vu VV, Au JS, Inoue A, Lee SM, Gebski V, Yang JC. Impact of EGFR inhibitor in non-small cell lung cancer on progression-free and overall survival: a meta-analysis. J Natl Cancer Inst. 2013 May 1;105(9):595-605. doi: 10.1093/jnci/djt072. Epub 2013 Apr 17.
- Cancer Genome Atlas Research Network. Comprehensive genomic characterization of squamous cell lung cancers. Nature. 2012 Sep 27;489(7417):519-25. doi: 10.1038/nature11404. Epub 2012 Sep 9. Erratum In: Nature. 2012 Nov 8;491(7423):288. Rogers, Kristen [corrected to Rodgers, Kristen].
- Ogino S, Lochhead P, Giovannucci E, Meyerhardt JA, Fuchs CS, Chan AT. Discovery of colorectal cancer PIK3CA mutation as potential predictive biomarker: power and promise of molecular pathological epidemiology. Oncogene. 2014 Jun 5;33(23):2949-55. doi: 10.1038/onc.2013.244. Epub 2013 Jun 24.
- Marks JL, Gong Y, Chitale D, Golas B, McLellan MD, Kasai Y, Ding L, Mardis ER, Wilson RK, Solit D, Levine R, Michel K, Thomas RK, Rusch VW, Ladanyi M, Pao W. Novel MEK1 mutation identified by mutational analysis of epidermal growth factor receptor signaling pathway genes in lung adenocarcinoma. Cancer Res. 2008 Jul 15;68(14):5524-8. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-08-0099.
- Gandhi L, Bahleda R, Tolaney SM, Kwak EL, Cleary JM, Pandya SS, Hollebecque A, Abbas R, Ananthakrishnan R, Berkenblit A, Krygowski M, Liang Y, Turnbull KW, Shapiro GI, Soria JC. Phase I study of neratinib in combination with temsirolimus in patients with human epidermal growth factor receptor 2-dependent and other solid tumors. J Clin Oncol. 2014 Jan 10;32(2):68-75. doi: 10.1200/JCO.2012.47.2787. Epub 2013 Dec 9.
- Borger DR, Tanabe KK, Fan KC, Lopez HU, Fantin VR, Straley KS, Schenkein DP, Hezel AF, Ancukiewicz M, Liebman HM, Kwak EL, Clark JW, Ryan DP, Deshpande V, Dias-Santagata D, Ellisen LW, Zhu AX, Iafrate AJ. Frequent mutation of isocitrate dehydrogenase (IDH)1 and IDH2 in cholangiocarcinoma identified through broad-based tumor genotyping. Oncologist. 2012;17(1):72-9. doi: 10.1634/theoncologist.2011-0386. Epub 2011 Dec 16.
- Turcan S, Rohle D, Goenka A, Walsh LA, Fang F, Yilmaz E, Campos C, Fabius AW, Lu C, Ward PS, Thompson CB, Kaufman A, Guryanova O, Levine R, Heguy A, Viale A, Morris LG, Huse JT, Mellinghoff IK, Chan TA. IDH1 mutation is sufficient to establish the glioma hypermethylator phenotype. Nature. 2012 Feb 15;483(7390):479-83. doi: 10.1038/nature10866.
- Yi ES, Boland JM, Maleszewski JJ, Roden AC, Oliveira AM, Aubry MC, Erickson-Johnson MR, Caron BL, Li Y, Tang H, Stoddard S, Wampfler J, Kulig K, Yang P. Correlation of IHC and FISH for ALK gene rearrangement in non-small cell lung carcinoma: IHC score algorithm for FISH. J Thorac Oncol. 2011 Mar;6(3):459-65. doi: 10.1097/JTO.0b013e318209edb9.
- Lux ML, Rubin BP, Biase TL, Chen CJ, Maclure T, Demetri G, Xiao S, Singer S, Fletcher CD, Fletcher JA. KIT extracellular and kinase domain mutations in gastrointestinal stromal tumors. Am J Pathol. 2000 Mar;156(3):791-5. doi: 10.1016/S0002-9440(10)64946-2.
- Carvajal RD, Antonescu CR, Wolchok JD, Chapman PB, Roman RA, Teitcher J, Panageas KS, Busam KJ, Chmielowski B, Lutzky J, Pavlick AC, Fusco A, Cane L, Takebe N, Vemula S, Bouvier N, Bastian BC, Schwartz GK. KIT as a therapeutic target in metastatic melanoma. JAMA. 2011 Jun 8;305(22):2327-34. doi: 10.1001/jama.2011.746.
- Lu HF, Yang JS, Lin YT, Tan TW, Ip SW, Li YC, Tsou MF, Chung JG. Diallyl disulfide induced signal transducer and activator of transcription 1 expression in human colon cancer colo 205 cells using differential display RT-PCR. Cancer Genomics Proteomics. 2007 Mar-Apr;4(2):93-7.
- Corless CL, Schroeder A, Griffith D, Town A, McGreevey L, Harrell P, Shiraga S, Bainbridge T, Morich J, Heinrich MC. PDGFRA mutations in gastrointestinal stromal tumors: frequency, spectrum and in vitro sensitivity to imatinib. J Clin Oncol. 2005 Aug 10;23(23):5357-64. doi: 10.1200/JCO.2005.14.068. Epub 2005 May 31.
- Thompson JD, Shibahara G, Rajan S, Pel J, Marziali A. Winnowing DNA for rare sequences: highly specific sequence and methylation based enrichment. PLoS One. 2012;7(2):e31597. doi: 10.1371/journal.pone.0031597. Epub 2012 Feb 15.
- Pel J, Broemeling D, Mai L, Poon HL, Tropini G, Warren RL, Holt RA, Marziali A. Nonlinear electrophoretic response yields a unique parameter for separation of biomolecules. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009 Sep 1;106(35):14796-801. doi: 10.1073/pnas.0907402106. Epub 2009 Aug 17.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvio)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
- HER2
- EGFR
- PIK3CA
- TP53
- KRAS
- Pitkälle edennyt melanooma
- Metastaattinen paksusuolen syöpä
- Kiertävä kasvain DNA
- BRAF
- Pitkälle edennyt ei-pienisoluinen keuhkosyöpä
- ALK
- PDGFRA
- c-KIT
- NRAS ja HRAS
- RAS-RAF-MEK-MAPK
- IDH1 ja IDH2
- STAT1&3
- Ruoansulatuskanavan Struma kasvain
- Ehdokasgeenit, jotka liittyvät mahdollisiin prognostisiin ja ennustaviin biomarkkereihin potilailla, joilla on kiinteitä kasvaimia
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Ruoansulatuskanavan sairaudet
- Hengityselinten sairaudet
- Neoplasmat, side- ja pehmytkudokset
- Neoplasmat histologisen tyypin mukaan
- Neoplasmat
- Keuhkosairaudet
- Neoplasmat sivustoittain
- Ruoansulatuskanavan kasvaimet
- Ruoansulatuskanavan kasvaimet
- Ruoansulatuskanavan sairaudet
- Hengitysteiden kasvaimet
- Rintakehän kasvaimet
- Syöpä, bronkogeeninen
- Keuhkoputkien kasvaimet
- Neuroektodermaaliset kasvaimet
- Neoplasmat, sukusolut ja alkiot
- Kasvaimet, hermokudos
- Paksusuolen sairaudet
- Suoliston sairaudet
- Suoliston kasvaimet
- Peräsuolen sairaudet
- Keuhkojen kasvaimet
- Kasvaimet, sidekudos
- Neuroendokriiniset kasvaimet
- Nevi ja melanoomat
- Karsinooma, ei-pienisoluinen keuhko
- Kolorektaaliset kasvaimet
- Ruoansulatuskanavan stroomakasvaimet
- Melanooma
Muut tutkimustunnusnumerot
- H14-01212
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .